国内で流通している主な市販ソフト(2003年6月現在)
商品名 | 国内販売会社 | 開発会社 | 機能・特徴 | 動作環境 | ソフト価格 | 出荷年月 | 販売実績 |
マテリアルサイエンス | アクセルリス | 米アクセルリス | − | − | − | − | − |
Materials Studio Discover | 〃 | 〃 | 高分子材料に最適な分子動力学計算エンジン | Windows | お問い合わせ下さい | − | − |
Materials Studio CASTEP | 〃 | 〃 | 密度汎関数法(Density Functional Theory)に基づいた第一原理平面波・擬ポテンシャルコードで、金属・半導体・絶縁体の結晶、界面、ならびに表面に対する計算を行うツール | 〃 | 〃 | − | − |
Materials Studio DMol3 | 〃 | 〃 | 密度汎関数法に基づいた第一原理計算プログラムで数値局在基底関数を使用。分子系と周期系双方の電子状態計算が可能 | 〃 | 〃 | − | − |
Materials Studio ReflexPlus | 〃 | 〃 | 粉末X線結晶回折データから結晶構造を精度よく計算予測するツール | 〃 | 〃 | − | − |
Materials Studio CombiMAT | 〃 | 〃 | 材料開発むけハイスループット実験データ管理システム | 〃 | 〃 | − | − |
Materials Studio FAST | 〃 | 〃 | 「フォーミュレーション」最適化設計データベースシステム | 〃 | 〃 | − | − |
ライフサイエンス | |||||||
Discovery Studio ViewerPro | 〃 | 〃 | 分子の3Dモデル表示と簡単なモデル解析のデスクトップ | 〃 | 〃 | − | − |
Discovery Studio Modeling | 〃 | 〃 | デスクトップ上での計算プロテオミクス&シミュレーションツール | 〃 | 〃 | − | − |
Discovery Studio MedChem Explorer | 〃 | 〃 | 医薬合成化学者むけファーマコファー解析/DB検索のためのWindows Client-Serverソフトウェア | SGI | 〃 | − | − |
Catalyst | 〃 | 〃 | ファーマコフォアベースの分子アラインメント、形状ベースの三次元サーチ、SAR データに基づくファーマコフォア仮説の自動作成、コンフォメーション空間を幅広くカバーした複数コンフォメーションの発生といった相補的機能を提供するツール | 〃 | 〃 | − | − |
Cerius2/ADME | 〃 | 〃 | 社内保有化合物ライブラリーやコンビナトリアルライブラリーなど、非常に多くの化合物を取り扱う場合に適したADME特性の解析及び予測のための高速計算ツール | 〃 | 〃 | − | − |
Cerius2/LigandFit | 〃 | 〃 | ハイスループットドッキング&スコアリングモジュール | 〃 | 〃 | − | − |
Cerius2/SBF | 〃 | 〃 | タンパク3D構造に基づく3Dファーマコフォアクエリーの構築と3D検索 | 〃 | 〃 | − | − |
Cerius2/CombiChem | 〃 | 〃 | コンビナトリアルケミストリーにおけるライブラリーデザインツール | 〃 | 〃 | − | − |
Cerius2/AutoLudi | 〃 | 〃 | 自動De novoデザイン&スコアリング | 〃 | 〃 | − | − |
Insight II | 〃 | 〃 | 生体高分子系分子モデリング、シミュレーション | 〃 | 〃 | − | − |
QUANTA x-ray | 〃 | 〃 | 生体高分子X線構造解析モデリング | 〃 | 〃 | − | − |
CNX | 〃 | 〃 | X線およびNMR構造精密化ソルバー | SGI, Linux, AIX | 〃 | − | − |
Felix | 〃 | 〃 | NMR構造解析、スペクトル・ビジュアライゼーション | Windows, SGI | 〃 | − | − |
ケムインフォマティクス | |||||||
RS3 | 〃 | 〃 | Oracleで構築された総合的ディスカバリー情報管理ソリューション | SUN, Windows | 〃 | − | − |
Accord | 〃 | 〃 | クライアント/サーバープラットフォーム上での化学薬品データ管理ツール | Windows | 〃 | − | − |
Accord for Excel | 〃 | 〃 | 化学計算、完全一致や部分構造一致によるフィルタリング、構造の類似度によるソートなど、化学者が日常的に用いているMicrosoft Excel上で自在に化学を取り扱うことのできる化学スプレッドシート | 〃 | 〃 | − | − |
Accord for Excel Combi Chem | 〃 | 〃 | 化学スプレッドシートのAccord for Excelにコンビケムのエニュミュレーションツールを統合し、一般反応式の入力、SDファイルなどから試薬リストを読込んでボタンを押すだけで化合物ライブラリーを作成するツール | 〃 | 〃 | − | − |
Failed Reaction | 〃 | 〃 | Accelrys監修、30余りの化学学会誌から、不良反応実例集を集めたユニークなデータベース | 〃 | 〃 | − | − |
Method in Organic Synthesis | 〃 | 〃 | 英国RSC刊の学会誌”Method of Organic Synthesis”より、重要な有機化学合成反応を収録したデータベース | 〃 | 〃 | − | − |
TOPKAT | 〃 | 〃 | 化学物質の毒性や環境的影響を分子構造のみから計算し、自動的に評価を確認するソフトウェアシステム | 〃 | 〃 | − | − |
TSAR | 〃 | 〃 | 統計的およびビジュアル分析ツールを使用してデータの傾向を調べる、完全統合された2D QSARパッケージ | 〃 | 〃 | − | − |
DIVA | 〃 | 〃 | 化学および生物学データを処理するデスクトップ・アプリケーション | 〃 | 〃 | − | − |
バイオインフォマティクス | |||||||
Wisconsin Package | 〃 | 〃 | 多様な研究ニーズに対応する配列解析ツール | SGI, Alpha | 〃 | − | − |
SeqWeb | 〃 | 〃 | Wisconsin Packageに対応するwebインターフェース | Windows | 〃 | − | − |
SeqStore | 〃 | 〃 | Oracleベースの配列情報管理DBMS | SUN ,AIX | 〃 | − | − |
MacVector | 〃 | 〃 | Macintoshにおける配列解析ツールのデファクトスタンダード | Mac | 〃 | − | − |
Discovery Studio Gene | 〃 | 〃 | 極めて優れた操作性を実現した配列解析デスクトップ | Windows | 〃 | − | − |
Discovery Studio GeneAtlas | 〃 | 〃 | HTM(High Throughput Modeling)を活用した高品質アノテーションサーバ | SUN, Linux | 〃 | − | − |
Discovery Studio AtlasStore | 〃 | 〃 | リレーショナルデータベースによるプロテオミクスデータ管理システム | SUN., Windows | 〃 | − | − |
DayCart | アダムネット | 米デイライト | 新製品、オラクル+Daylight化学情報管理システム | SGI、SUN、Linux | 詳細問い合わせ | 2000年9月 | − |
Daylight DBMS | 〃 | 〃 | 複雑なクエリーによる高速検索可能な化合物、反応のデータベース管理システム | 〃 | 〃 | 92年1月 | − |
Clustering Package | 〃 | 〃 | Daylight Fingerprint 使用のクラスタリングソフト | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Rubicon | 〃 | 〃 | Smiles から3D構造、コンホメーション発生ソフト | 〃 | 〃 | 〃 | − |
PCModels | 〃 | 〃 | 2D構造からClogP、CMR を推算するソフト | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Smiles Toolkit | 〃 | 〃 | SD、RD、Mol、Mol2 各ファイルとSmilesファイルとの相互変換ツール。TPSAの計算可能。 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Smarts Toolkit | 〃 | 〃 | 複雑な検索クエリーの作成ツール,バーチャルスクリーニングのプログラムに最適 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Reaction Toolkit | 〃 | 〃 | 反応ルールに基づいてバーチャルライブラリーを構築するツール | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Fingerprint Toolkit | 〃 | 〃 | 独自のFingerprint 作成ツール、Fingerprintにより類似度計算 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Daylight Java Tools | 〃 | 〃 | Jaba によるDaylight プログラムへのGUI | 〃 | 〃 | 98年10月 | − |
DayCGI Tool | 〃 | 〃 | Web によるDaylightデータベースへのアクセス | 〃 | 〃 | 〃 | − |
TCM | 〃 | 〃 | 新製品、中国3000年の歴史を誇る漢方薬の化学構造データベース | 〃 | 〃 | 2002年1月 | − |
Medchem データベース | 〃 | 米バイオバイト | LogP実測値データベース(約34,000件) | 〃 | 〃 | 92年1月 | − |
WDIデータベース | 〃 | 英ダウエント | ダウエントWorld Drug Index データベース | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Spresi React データベース | 〃 | 独インフォケム | 化学反応データベース(250万反応) | 〃 | 〃 | 〃 | − |
CCR データベース | 〃 | 米ISI | 化学反応データベース(25万反応)。年々3万件追加 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Index Chemicus データベース | 〃 | 〃 | 有機化学のジャーナルから抽出された最新化合物データベース(60万構造) | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Maybridge データベース | 〃 | 英メイブリッジ | 試薬カタログ。5万件全てMaybridge社から供給可能 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
ACD データベース | 〃 | 米MDL | Available Chemical Dirrectory 約25万試薬 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
NCI データベース | 〃 | 米NCI研究所 | 国立癌研究所データベース約12万化合物 | 〃 | 〃 | 92年1月 | − |
CQSAR | 〃 | 米バイオバイト | Hansch による過去20年にわたるQSAR関連データベースを含む構造活性相関モジュール | Alpha/OpenVMS | 〃 | 97年1月 | |
CLogP | 〃 | 〃 | Hansch・Leo によるLogP/CMR 推算ソフト(Mac版、Win版)No Missing Fragment | Mac、Windows、SGI | 〃 | 95年4月 | − |
DockIt | 〃 | 米メタフォリックス | ターゲット蛋白とデータセットのドッキングで、コンホメーションを考慮する。コンビケムでバーチャルライブラリのスクリーニングに最適 | SGI、SUN | 〃 | 2000年1月 | − |
LUNA | 〃 | 〃 | 蛋白質ーリガンド データベース | 〃 | 〃 | 2002年1月 | |
Fingerprint Generation Package | 〃 | 英BCI | Dictionary をもとにFingerprintを作成 | UNIIX, PC | 〃 | 97年1月 | − |
Clustering Package | 〃 | 〃 | Ward法、K-Means法、J-P法など各種クラスタリングパッケージ | 〃 | 〃 | 97年1月 | − |
Diversity Analysis Pakage | 〃 | 〃 | 構造のDiversityを計算しデータセットを評価し、また特異構造を選抜する | 〃 | 〃 | 97年1月 | − |
INForm | 〃 | 英I.L. | ニューラルネットによる配合設計 | Wnows | 〃 | 2003年4月 | − |
GENIE | アドバンスドテクノロジーインスティテュート | アドバンスドテクノロジーインスティテュート | DNA・たん白質情報の統合解析システム。とりわけ、独自開発によるホモロジーモデリングに基いたたん白質の立体構造予測システムは、予測した構造の局所的な予測精度を推定することができるという独特の機能を備えている | サンSPARC(インターネットによる利用が可能) | 150万円 | 94年1月 | − |
MolWorks Ver1.7 | ベストシステムズ | ベストシステムズ | 分子設計のためのビルダーを備え、物性値の推算およびGAUSSIAN、MOPAC、GAMESSへの入出力インタフェースを備えている。ダウンロード先: http://www.molworks.com/ | WIndows98、WindowsNT/2000、MacOS、Linux | 無償 | 2000年9月 | - |
Q-Chem | 〃 | 米キューケム | オーダーNアルゴリズムを適用した大規模分子系ab initio分子軌道計算プログラム | Linux、IBM、SGI、Compaq Alpha、SUN | 別途問い合わせ | 1993年3月 | - |
HyperChem | 〃 | 米ハイパーキューブ | 低分子の有機化合物からたん白質や核酸まで幅広い系に対応したウィンドウズ版分子設計支援ツール。MM、MD、MO、MCなどの計算機能を備えている | WIndows95/98、2000/NT/XP | 別途問い合わせ | 1994年 | - |
CHEMKIN | リアクションデザイン・ジャパン | 米リアクションデザイン | 化学反応(気相反応、表面反応)を伴う流れ場のモデリングツール。CVD薄膜成長、燃焼、化学プロセス,環境の分野で幅広く応用 | Windows 98/2000/NT、Linux, SUN、SGI、HP、Compaq Alpha, IBM AIX | 別途問い合わせ | 1997年6月 | - |
KnowItAll (ノウ・イットオール) インフォマティクシステム | 日本バイオ・ラッド ラボラトリーズ | 米バイオ・ラッド ラボラトリーズ | IR、Raman、NMR、MSスペクトルを1つのアプリケーションで扱うことのできる画期的なソフト。ユーザーが必要なツールを組み合わせて購入することができる | Windows98以上 | 96万円から、詳細問い合わせ | 2001年10月 | − |
ハブ・イットオール ライセンスキー | 〃 | 〃 | サドラーのスペクトルデータベースすべてを1年間制限なく検索利用することのきるプライスシステム | 〃 | IR 98万円、NMR 80万円、MS55万円/1年間 | 2003年4月 | − |
IRパッケージデータベース ver.5 | 〃 | 〃 | − | − | 詳細問い合わせ | 2000年4月 | − |
Computational Chemistry Total Solutions | 分子 | 分子 | Gaussian 03 などの量子化学計算を中心とした総合的コンサルティングを展開中。Linux, Unix の分子計算システム構築を受注している。Chemi-, BioInformatics などのソフトウェアの技術情報が充実している | SUN、RS/6000、HP、IRIS, Windows | 10万〜300万円(アカデミック価格あり) | 1987年7月 | − |
CONFLEX2000 | コンフレックス | コンフレックス | CONFLEX2000は、フレキシブルな分子の配座空間を探索し、化学的に重要な配座異性体の最適化構造を洩れなく見つけだす。今までの構造最適化プログラムでは、ユーザが入力した初期構造に依存した、局所的な最適化構造しか求めることができなかった。最安定構造でさえも、特定することが困難だった。これでは、フレキシブルな分子の性質や挙動に関して、限られた情報しか得ることができない。これらの問題を解決するための配座探索プログラムが、バージョンアップされたCONFLEX2000である | Mac、Linux、Windows、SGI | お問い合わせ | 2001年4月 | − |
Parallel CONFLEX | 〃 | 〃 | 並列化された CONFLEX2000は、鎖状部分の結合の回転・環を構成する原子のFlap・Flipにより、初期構造を変形させる微小変形により発生する複数の出発構造を複数のコンンピュータに分散させて構造最適化を行う。ポストゲノム研究、新機能材料開発などで扱う系は非常にサイズが大きい場合が多くPC1台で手軽に配座探索計算を行うことはできない。特に最近のポストゲノム研究で注目されるタンパク質やDNA、RNAなどの生体高分子はさまざまな三次元構造を有する多配座分子であり、これらの立体構造を分子計算で解析する皆様のためにもParallel CONFLEXは有効 | Mac、Linux、Windows、SGI、MDエンジンII | 〃 | 2001年4月 | − |
AMBER7 | 〃 | 米カリフォルニア大学 | AMBERは、カリフォルニア大学の故コールマン教授らのグループによって生体分子のために開発された、モデリングおよびモレキュラーメカニックスとダイナミックス計算シミュレーションのパッケージ。モデリングではparm96やOPLSなどの構造データベースをもち、溶媒水分子の配置やチャージのフィッティングを行なうなどのビルダーモジュールが多数用意されている | UNIX、Linux、MDエンジンII、Windows | 〃 | 2000年4月 | − |
MDエンジンII | 〃 | 富士ゼロックス | 分子動力学を用いたシミュレーションを高速化するアクセラレータボード。パソコンのPCIスロットに装着して使用することも可能で、高速かつ高精度な計算を実現 | Linux、Windows | 〃 | 2000年4月 | − |
Gaussian03 | 〃 | 米ガウシアン | Gaussian 03は、1999年に実験データから導き出される経験的パラメータを一切用いない非経験的分子軌道法の普及の功績によりノーベル賞を受賞したJ.A.Popleらによって開発されました。新たに追加されたONIOM法により、電子構造理論を巨大分子についても現実的なものとし、分子特性の予測範囲を拡張しました | UNIX、Linux、Windows、Mac | 〃 | 2003年4月 | ー |
BioBookG4 | 〃 | コンフレックス | BioBookG4は、バイオ研究者向けのポピュラーなツールをApple PowerBookG4にセットアップ済みでお届けする、研究者個人向けバイオインフォマティクス支援システムです。バイオインフォマティクスと計算生物学は急速に発展する科学分野で、今日ではコンピュータベースのツール無しに、研究開発分野の情報で優位に立つことは不可能です。一年間のサポート付きですから、初心者の方も安心して研究開発のツールとして研究時間短縮にご利用いただけます | Mac、Windows | 〃 | 2003年4月 | − |
配座創出コンサルティング | 〃 | 〃 | DNAや蛋白質などに代表される生体高分子の三次元立体構造は、それらの活性や物性を研究する上で欠くことのできない情報です。配座創出コンサルティングは新たに開発された、シーケンス型配座創出アルゴリズムと並列計算システムを応用することによって、数千原子分子程度の有機化合物(数百塩基対相当)の立体配座を短時間で創出するサービスです | − | 〃 | 2003年4月 | − |
BARISTA | 〃 | 〃 | BARISTAは、独自の多配座解析機能に加えて、分子構造解析・分子軌道解析・基準振動解析・動力学的解析機能を有する解析支援のためのプラットホームです。BARISTAは、分子計算プログラムにより計算された結果をもとに分子構造のコンピュータグラフックスを作成・表示することができ、その結果を容易に解析することができるように支援することを目的としています | Linux, Windows | 〃 | 2002年4月 | − |
MAAT | CRCソリューションズ | CRCソリューションズ | マイクロアレイ発現解析ソフト、発現率をガンマー分布と仮定した手法と複数実験データにより解析精度を向上させる調整P値法をモデル化 | Windows98/Me、2000/NT | 定価120万円。詳細要問い合わせ | − | − |
MUGEN Extractor | 〃 | 〃 | バイオ文献テキストマイニングツール。PubMed検索結果のアブストラクトからキーワードに関連する遺伝子名や化合物名を抽出しキーワードとの関連性の強さ、シグナルパスウェイなどを調査することができる。その他、研究を効率化・高速化するための機能を備える | Windows2000/XP | 定価200万円。詳細要問い合わせ | − | − |
ChemReact | CTCラボラトリーシステムズ | 独インフォケム | VINITI(旧ソ連)とZIC(独)から収集された330万件の化合物データから同一反応タイプを排除したデータベース | SGI、Sun、NT | 要問合せ | − | − |
ChemSynth | 〃 | 〃 | ChemReact中から著名なジャーナルに発表されており、収率が50%以上の反応のみを抜粋したデータベース | 〃 | 〃 | − | − |
CoRM | 〃 | CTCラボラトリーシステムズ | 試薬管理、発注システム | 〃 | 〃 | − | − |
Activity Base | 〃 | 英IDビジネスソリューション | HTS、マニュアルアッセイの双方に対応したクライアントサーバー型のアッセイ情報管理システム | IBM RS/6000、SGI IRIS、DECAlphaVAX、WindowsNT、Sun | 〃 | − | − |
XLFit | 〃 | 〃 | アッセイデータの解析を支援するMS-Excelのアドオンソフト | WindowsNT、Windows95、2000 | 10万5,000円 | − | − |
SARGen | 〃 | 〃 | ISIS上の構造式とアッセイデータをリンクして表示するレポートツール | WindowsNT、Windows2000 | 要問合せ | − | − |
DEREK for Windows | 〃 | 英ラーサ | ルールベースに基づく化合物毒性予測プログラム | 〃 | 〃 | − | − |
METEOR | 〃 | 〃 | ルールベースに基づく代謝予測システム | 〃 | 〃 | − | − |
CORINA | 〃 | 独モレキュラーネットワークス | 大規模3D-Chemical-Database構築を目的としたAutomatic 3D-Structure Generatorプログラム | SGI、IBM、Sun | 〃 | − | − |
TOX staff 21 | 〃 | CTCラボラトリーシステムズ | 安全性試験の統合的な支援システム。一般毒性、病理、臨床病理、生殖毒性、統計解析 | サーバー:WindowsNT、SUN、クライアント:Windows | 〃 | − | − |
ADME staff | 〃 | 〃 | 薬物動態試験の総合的な支援システム。臨床、非臨床PK,TK試験、濃度計算、LA | 〃 | 〃 | − | − |
SQL*Stability | 〃 | 米アプライドバイオシステム | 製剤、安定性試験支援システム。プロトコル作成、スケジュール管理、LA | サーバー:WindowsNT/2000、SUN、クライアント:Windows | 〃 | − | − |
SQL*QA | 〃 | 〃 | 治験薬GMP、GMP向け品質保証システム。ロットQA、QC、ロットアナロジー管理、LA | 〃 | 〃 | − | − |
SQL*LIMS | 〃 | 〃 | ラボラトリー情報管理システム。QC、分析、LAのコアシステム | 〃 | 〃 | − | − |
Documentum | 〃 | 米ドキュメンタム | エンタープライズコンテンツマネジメントシステム+Webブラウザー | サーバー:SUN、HP、NT、クライアント:Windows、Webブラウザー | 〃 | − | − |
ARISg/j | 〃 | 米Clinarium | 国内外対応副作用症例データ管理システム | サーバー:SUN、NT、クライアント:Windows | 〃 | − | − |
Oracle Clinical | 〃 | 米オラクル | マルチ言語対応臨床データ管理システム。海外治験への対応が可能 | サーバー:SUN、HP、NT、クライアント:Windows | 〃 | − | − |
Oracle TMS | 〃 | 〃 | MedDRA、自社辞書などGCP・GPMSPにおける辞書の統合管理を可能にします | 〃 | 〃 | − | − |
PH.DataWare | 〃 | 米SAS | 臨床データウェアハウジングツール。CDMS〜解析環境のデータの流れ、データ抽出・変換・加工のプロセス管理と文書化 | 要問合せ | 〃 | − | − |
PH-Clinical | 〃 | 〃 | 臨床試験データの解析環境。バリデートと監査証跡を考慮した解析、レポート作成、解析プログラムの標準化を支援 | 〃 | 〃 | − | − |
bioSCOUT | 〃 | 独ライオン | 統合化配列解析システム | サーバー:SGI、Compaq、クライアント:Webブラウザー | 〃 | − | − |
Lion Discovery Center | 〃 | 〃 | Bio、Cheminformaticsエリアにおけるデータ統合化ソリューション | サーバー:SGI、LINUX、Compaq、SUN、クライアント:NT、Linux | 〃 | − | − |
Lion Target Engine | 〃 | 〃 | Bioinformatics用、遺伝子解析、テキストマイニング、パスウェイ解析等の研究支援ツール | 〃 | 〃 | − | − |
Lion Lead Engine | 〃 | 〃 | Cheminformatics用研究支援、解析ツール | 〃 | 〃 | − | − |
SRS | 〃 | 〃 | 生物データベースマネジメントシステム | サーバー:SUN、SGI、Compaq、Linux、クライアント:Webブラウザー | 〃 | − | − |
GlycoSuite DB | 〃 | 豪プロテオームシステムズ | 糖鎖文献データベース | サーバー:Linux、SGI、SUN、Compaq、クライアント:Webブラウザー | 〃 | − | − |
Genomatix Suite | 〃 | 独Genomatix | Genomatix社トータルソリューションパッケージ | Internet経由 or Linux Server | 〃 | − | − |
PromoterInspector | 〃 | CTCラボラトリーシステムズ | 哺乳類のプロモータ予測ソフト | 〃 | 〃 | − | − |
MatInspector | 〃 | 〃 | 転写因子サイト予測ソフト | 〃 | 〃 | − | − |
GEMSLauncher | 〃 | 〃 | プロモータ領域解析パッケージ | 〃 | 〃 | − | − |
ElDorado | 〃 | 〃 | プロモータ領域アノテーション付、遺伝子データベース (ヒト、マウス、ラット、アラビド) | 〃 | 〃 | − | − |
Chip2Promoter | 〃 | 〃 | 発現解析時のプロモータ解析ツール | 〃 | 〃 | − | − |
BiblioSphere | 〃 | 〃 | 遺伝子-遺伝子間、遺伝子-転写因子間の文献マイニングデータベース | 〃 | 〃 | − | − |
SIMS | 〃 | 米Scimagix | イメージデータ管理システム | サーバー:Sun、Win、Oracle クライアント:web | 〃 | − | − |
ProteinMine | 〃 | 〃 | 2次元電気泳動装置用、イメージ解析ソフト | Sun、Win | 〃 | − | − |
arrayTAG | 〃 | 独ライオン | 高品質なMicroarray作成用cDNAクローン | − | 〃 | − | − |
arrayBASE | 〃 | 〃 | arrayTAGの情報 | Webブラウザー | 〃 | − | − |
ProteinAtlas | 〃 | 英Confirmant | ヒト疾患タンパクの機能同定データベース+遺伝子情報データベース | サーバー:Linux、SGI、SUN、Compaq、クライアント:Webブラウザー | 〃 | − | − |
SRS Objects | 〃 | 〃 | SRSと様々なツールを統合するインターフェース | SGI、Compaq、SUN、Linux | 〃 | − | − |
SRS Prisma | 〃 | 〃 | SRSで管理されているデータベースをアップデートするモジュール | 〃 | 〃 | − | − |
ProteomIQ、BioinformatIQ | 〃 | 豪プロテオームシステムズ | プロテオーム研究時のLIMSソリューション | AIX | 〃 | − | − |
DIP | 〃 | 米プロテインパスウェイ | タンパク−タンパク相互作用データベース | 〃 | 〃 | − | − |
FGENEシリーズ | 〃 | 米ソフトベリー | 遺伝子領域予測ツール | UNIX | 〃 | − | − |
Renaissance Software | 〃 | 米シミックステクノロジーズ | コンビケムの技術を用いて材料開発を支援するソフトウェア | WindowsNT、Oracle | 〃 | 2001年1月 | − |
Discovery Tools Polyolefins Systems | 〃 | 〃 | ハイスループットでポリマー重合用触媒の開発を行う装置 | WindowsNT、Oracle(ソフトに関して) | 〃 | − | − |
Discovery Tools Heterogeneous Catalysis Systems | 〃 | 〃 | ハイスループットで固体触媒の開発を行う装置。1次及び2次スクリーニング装置が含まれている | 〃 | 〃 | − | − |
Discovery Tools Polymer Properties Systems | 〃 | 〃 | ポリマー自体の特性評価を微量サンプルからハイスループットで行うことが可能 | 〃 | 〃 | − | − |
Discovery Tools Pre-Formulations Systems | 〃 | 〃 | 医薬品候補化合物の物性評価時における塩及び結晶多形のスクリーニングを行うシステム | 〃 | 〃 | − | − |
コラボレーション(マテリアルサイエンス) | 〃 | 〃 | 合成用触媒、重合用触媒、化粧品原料、顔料などの受託研究や共同開発を行う | − | 〃 | − | − |
コラボレーション(ファーマシューティカル) | 〃 | 〃 | 塩、結晶多頚のスクリーニングやプロセス研究などの分野において、受託研究や共同開発を行う | − | 〃 | − | − |
Space Finder | ダイキン工業 | ダイキン工業 | Webブラウザーから分子モデリング、及びGaussian、MOPACへの計算起動と計算結果の可視化 | Windows、LinuxPC、SGI、Compaq、SUN、HP、IBM | 別途問い合わせ | 2001年3月 | − |
CCS Farm | 〃 | 〃 | Gaussian,DOC,Amber等の計算最適化、付加分散、計算スケジューリングシステム | Windows、LinuxPC、SGI、Compaq、SUN、HP、IBM | 〃 | 2002年12月 | − |
DiscoveryStudio | 〃 | 米アクセルリス | ライフサイエンス向け統合分子モデリング、シミュレーションパッケージ。DiscoveryStudioの各種モジュールを組み合わせることで目的にあわせた高度なシミュレーションが可能 | GUI: Windows、計算:Windows、IBM、Linux | 〃 | 2002年11月 | − |
MaterialsStudio | 〃 | 〃 | マテリアルサイエンス向け統合分子モデリング、シミュレーションパッケージ。MaterialsStudioの各種モジュールを組み合わせることで、有機、無機に関わらず、様々なシミュレーションが可能 | GUI:Windows、計算:WindowsHP、Linux | 〃 | 2000年9月 | − |
InsightU | 〃 | 〃 | ライフサイエンス向け統合分子モデリング、シミュレーションパッケージ。InsightU配下の各種モジュールを組み合わせることで目的にあわせた高度なシミュレーションが可能 | SGI | 〃 | − | − |
Cerius2 | 〃 | 〃 | 統合分子モデリング、シミュレーションパッケージ。Cerius2の各種モジュールを組み合わせることで、有機、無機に関わらず、様々なシミュレーションが可能 | 〃 | 〃 | − | − |
QUANTA | 〃 | 〃 | 蛋白質X線構造解析、フィッティングソフトウェア | 〃 | 〃 | − | − |
MOPAC2002、WinMOPAC | 〃 | 富士通 | 高分子向けにDistanceCutoff法を用いた局在化分子軌道計算プログラム、Windows版MOPAC | Windows他 | 〃 | 1999年4月 | − |
Chemistry 4-D Draw 7.0 | ディジタルデータマネジメント | 米ケムイノベーションソフトウエア | 構造式の作図機能のほか、構造式からIUPAC名を作成、IUPAC名から構造式を作成、構造式と文書や物性のテーブルを作成して部分構造式などから検索 | Windows3.1、95、98、Me、NT4.0、2000、Xp、Macintosh(Classic) | 2万3千円〜8万4千円、1万5千円〜4万8千円(アカデミック) | 2002年7月 | 国内1,900本 |
Merck Index, 13th CD-ROM | 〃 | 米ケンブリッジソフト | 10300j化合部の識別情報、商標名、CAS番号、物性、毒性、構造式、薬学的作用、処方、特許情報などを集めた化学者必携の書籍のCD_rOMデータベース | Windows3.1、95、98、Me、NT4.0、2000 、Xp | 8万7千円(一般)、3万8千円(アカデミック) | 2001年9月 | 弊社扱い50本 |
Derwent GENESEQ | トムソンダウエント、トムソンISI | 英トムソンダウエント | 世界中から集めた包括的な核酸・アミノ酸に関する特許・配列情報データベース製品 | Internet Explorer 5.0以上 または Netscape 6.0以上 またはインハウス検索システム | 詳細をお問い合わせください | 2002年 6月 | - |
Derwent GENESEQ FASTAlert | 〃 | 〃 | 毎週、遺伝子配列・特許に関するカレントアウェアネスなサービスを提供 | 〃 | 〃 | 2002年 6月 | - |
Derwent Discovery | 〃 | 〃 | Derwent Drug File とDerwent World Drug Alerts Plusの二つのデータベースからなる、ウェブで検索可能な製薬および薬剤関連特許・文献情報データベース製品 | Internet Explorer 5.0以上 または Netscape 6.0以上 | 〃 | 2003年 3月 | - |
Derwent Biotechnology Resource | 〃 | 〃 | 特許、文献ジャーナル、学術会議レポートからまとめたバイオテクノロジー関連情報を収録 | 〃 | 〃 | 2002年 6月 | - |
Derwent Innovations Index | 〃 | 〃 | 特許情報データベースのDerwent World Patents Index と引用特許情報データベースのDerwent Patents Citation Indexを、ISI社の引用間リンクの技術で統合したWebベースの特許情報データベース製品 | 〃 | 〃 | 2003年 6月 | - |
Derwent Analytics | 〃 | 〃 | 特許情報データベース Derwent World Patents Index の分析・解析ツール | Windows95、98、2000、ME、WindowsNT4.0(128MB RAM以上) | 〃 | 2003年 6月 | - |
Web of Nanotechnology | 〃 | 〃 | 1963年からの35,000件の特許情報:Derwent World Patents Index(年間10,000件追加更新)や、トムソンISI社が提供する185,000件の雑誌・専門誌などの文献情報:ISI Web of Science(年間25,000件追加更新)の情報、さらに専門家が厳選したウェブサイト情報を基に構成されており、さまざまな産業にわたるナノテクノロジー先行技術情報の広範囲な検索が可能。 | Internet Explorer 5.0以上 または Netscape 6.0以上 | 〃 | 2003年 2月 | - |
Derwent WPI Global Intranet Solution | 〃 | 〃 | Lotus Notesの機能性とフォーマットを利用してダウエント社の特許情報を利用することができます。世界で最も頻繁に利用されているグループウェアアプリケーションを利用することにより、グループ、企業で情報を社内データベースとして利用することが可能。 | Lotus Notes、Internet Explorer 5.0 以上 | 〃 | 2002年 2月 | - |
CrossFire BEILSTEIN | 富士通九州システムエンジニアリング | 独MDLインフォメーションシステムズ | 1771年からの850万件の化合物情報およびその物性、1000万件の反応情報を統合した有機化学データベースシステム。1980年以降の論文タイトルと要旨を追加収録。さらに Pharmacological、Ecologicalデータとして薬理、生物、活性、毒性等のデータを収録 | サーバー:IBM RS/6000、WindowsNT、クライアント:WindowsNT、95、98、Me、2000、PowerMac | 別途問い合わせ | 1999年11月 | − |
CrossFire GMELIN | 〃 | 〃 | GMELINハンドブックを電子化した無機、有機、金属化学分野のデータベースシステム | 〃 | 〃 | 1996年7月 | − |
CrossFire Direct | 〃 | 〃 | MDL GmbH社のCrossFireサーバーにインターネット経由でアクセスできるサービス | 〃 | 〃 | 1996年10月 | − |
SPRESI | 〃 | 独インフォケム | ロシアVINIT研究所、ドイツZIC研究所の共同プロジェクトの成果をベースに作成された化学情報データベース。400万件の有機化合物・有機金属化合物情報、300万件の反応情報を含み、汎用Webブラウザで検索が可能 | Windows95/98、Mac | 民間13万円、教育機関6万5千円:マルチユーザライセンス(10パスワード)、プレミアムユーザライセンス(25〃)あり | 2000年7月 | − |
LiqCryst 4.1 | 〃 | 独LCIパブリッシャー | 液晶化合物の8.2万件、文献3.8万件以上を収録した液晶データベースとその検索ソフトウエア | Windows95、98、ME、NT4.0、2000 | 民間160万円、教育55万円(年間サポート含む) | 1995年6月 | − |
WinMASPHYCコンサルティングパック | 〃 | 富士通九州システムエンジニアリング | 分子動力学教育ソフト。富士通製分子動力学ソフトWinMASPHYC Proを題材に、分子動力学を使って研究を行なう際に必要となる、種々のノウハウやテクニックを、WebベースのGUIで体験的に学習する製品。学生実験・教育設備として教育機関用にパック商品あり | Windows95/98/Me、NT/2000 | 民間10万円、教育機関5万円(教育用パック商品10パック:35万円、20パック:60万円、50パック:137万5千円) | 2001年4月 | − |
GeneDiscovery 1.1 | 〃 | 〃 | 遺伝子/タンパク質データベースに対してホモロジー検索、モチーフ検索を行い、新規遺伝子等にアノテーションを行うためのシステム。アミノ酸シークエンスよりそのタンパク質の機能予測を行う機能も新規に搭載 | サーバー:Linux、クライアント:Webブラウザー | パッケージ価格450万円、システム運用費50万円 | 2001年11月 | − |
ChemNavi | 〃 | 〃 | Webプラウザー上で、薬品の購入から廃棄までを管理するシステム。天秤による液量の管理が可能。スタンドアロン、クライアントーサーバーでの運用が可能 | サーバー:WindowsNT、クライアント:Windows95以降 | 基本システム:100万円)、追加クライアントライセンス:20万〜(民間)、10万〜(教育機関)、その他オプションやカスタマイズは別途問い合わせ | 2001年4月 | − |
LaimNavi | 〃 | 〃 | DNAチップなどの実験データを、大規模データベースを利用して管理するシステム。データベースの操作はすべてWebブラウザから行うことができる。ユーザの実験内容に応じてカスタマイズが可能 | サーバー:Windows2000、Solaris、クライアント:Webブラウザー | 基本システム:500万円〜 | 2002年1月 | − |
(仮称)MedScreen | 〃 | 〃 | MedScreenは、従来から行ってきた薬理活性主体のIn Silico解析と同時に、ADME-Toxを同時に評価するための「インテグレーテッド高速/仮想インシリコスクリーニング」システム。薬理活性とともに、薬物動態や毒性に関する吸収、代謝予測、毒性予測等の問題を同時に評価することで、大量の化合物ライブラリから、ヒット化合物としての確率をあげるための母集団の絞り込み、さらにリード化合物の最適化へのアプローチを強力に支援する | サーバー:Windows2000、クライアント:InternetExplorer5.5以降 | 1,000万円〜 | 2003年9月 | − |
薬師−Xsi | 富士総合研究所 | 富士総合研究所 | 三次元配座生成のXsi-Conf、三次元構造活性相関解析を行うXsi-SDQSAR、たん白質とのドッキングシミュレーションを行うXsi-Dock、ウェブユーザーインターフェースのXsi-Web、JavaベースのユーザーインターフェースであるXsi-WS、XML専用化学データベース管理システムのXsi-DB、ホモロジーモデリングツールのXsi-Homologyから構成される。Xsi-DB用のデータコンテンツとして医薬とペプチド、コンビナトリアルケミストリーのデータが用意されている | Linux | − | 2003年3月 | − |
WinMOPAC 3.5 | 富士通 | 富士通 | パソコン版分子軌道計算ソフト。MOPAC2002とMOS-Fを搭載。 分子構築から計算の実行、結果の可視化までをシームレスに実現 | Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 25万円(企業)、15万円(教育機関) | 2001年3月 | − |
WinMOPAC 3.5 Pro | 〃 | 〃 | 高分子対応パソコン版分子軌道計算ソフト。MOPAC2002とMOS-Fを搭載。 分子構築から計算の実行、結果の可視化までをシームレスに実現 | 〃 | 60万円(企業)、30万円(教育機関) | 2001年3月 | − |
MOPAC2002 ver.1.0 | 〃 | 〃 | 巨大分子系の分子軌道を高速計算。たん白質、核酸、高分子材料等の電子構造もスピーディに解析。 MOS-Fも添付 | VPP、SGI、COMPAQ、HP、IBM等 | 80万円〜(企業)、40万円〜(教育機関) | 2001年10月 | − |
ChemFrontier V1.0 | 〃 | 〃 | 化学構造式/反応式作画ソフト。フリーハンド作画、自動整形機能、3D変換機能など多彩な機能装備。 WinMOPACの入力データ作成支援 | Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 5万円(企業)、2万5千円(教育機関)、1万3,800円(学生) | 99年3月 | − |
ChemLib | 〃 | 〃 | 分子情報を取り扱う(座標整形、3D化など)Fortranで開発されたライブラリ群。C++やFortranからライブラリを利用し、独自のモデリングプログラムを開発する事が可能 | Windows98、NT4.0/2000、Me、XP、Sファミリ(Sun)、SGI | 600万円 | 2000年1月 | − |
BioFrontier | 〃 | 〃 | 基本的な代謝反応と酵素阻害剤についての情報を体系的に収載したパソコン用データベース。構造式や反応式、さらには反応経路などをキーとして目的とする情報を得ることが可能 | Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 120万円(企業)、40万円(教育機関) | 2001年8月 | − |
BioFrontier/P450 | 〃 | 〃 | P450の代謝反応(構造)を収めたDBと代謝物予測機能を持ち合わせた薬物代謝研究支援システム。データは年4回更新 | Windows2000/NT/XP | システム300万円、データ200万円(年間) | 2002年12月 | − |
ChemDraw Ultra/Pro/Std | 〃 | 米ケンブリッジソフト | 世界標準の化学構造式/反応式作画ソフトウエアで、構造式・反応式・反応機構等を簡単に作画可能 | Windows98、NT4.0、2000、Me、XP、MacOS | 12万5千円〜(企業)、5万3千円〜(教育機関) | 95年1月 | − |
Chem3D Ultra | 〃 | 〃 | 操作性の優れた分子モデリングシステムで、3次元立体構造への容易なアクセスを実現。CS MOPAC Proをバンドル | 〃 | 21万5千円〜(企業)、10万7千円〜(教育機関) | 95年1月 | − |
E-Notebook Ultra | 〃 | 〃 | 合成実験ノートの記録をパソコンで簡単に管理できるソフト。部分構造、反応変換、プロジェクト名などによるデータ検索が可能 | Windows98、NT4.0、2000、Me、XP | 32万3千円〜(企業)、18万8千円〜(教育機関) | 2002年3月 | − |
The Merck Index | 〃 | 〃 | 化学の百科事典「The Merck Index 13th Edition」の電子データ版。10,000件を超える化合物から、名称・CAS番号・構造式などをキーに素早い検索が可能 | 〃 | 12万5千円〜(企業)、5万3千円〜(教育機関) | 2002年3月 | − |
ChemOffice Pro | 〃 | 〃 | ChemDraw Ultra、Chem3D Pro、ChemFinder Pro、化学データベース(Winのみ)のバンドル製品 | Windows98、NT4.0、2000、Me、XP、MacOS | 39万5千円〜(企業)、24万2千円〜(教育機関) | 95年1月 | − |
ChemOffice Ultra | 〃 | 〃 | ChemDraw Ultra、Chem3D Ultra、ChemFinder Pro、化学データベース(Winのみ)のバンドル製品 | 〃 | 53万9千円〜(企業)、32万3千円〜(教育機関) | 96年8月 | − |
ChemOffice WebServer | 〃 | 〃 | Web対応の化学情報管理システム。化学構造情報や反応情報を容易 にDB構築でき、ブラウザーから簡単に 検索することが可能。各種業務アプリのオプションあり | WindowsNTサーバー4.0、Windows2000サーバー | 300万円〜(企業)、200万円〜(教育機関) | 99年1月 | − |
WinMASPHYCシリーズ | 〃 | 富士通 | WinMASPHYCは、パソコンで世界初の本格的分子動力学システム。有機物だけでなく金属、無機物の計算も行うことが可能。二次解析機能も充実。C/S連携でLinuxを含むUNIX-OS並列ソルバーとも連携可 | Windows98/Me、NT4.0/2000、XP | Ultra:180万円(教育機関90万円)、Pro:60万円(同30万円)、Std:10万円(同5万円) | 98年9月 | − |
CACheワークシステム | 〃 | 〃 | 三次元(立体)分子計算モデリングシステム。三次元分子モデルの入力/編集およびMOPAC、ZINDO、拡張MM2およびMM3等の計算ができ、反応性の予測、遷移状態探索、QSARへの応用等幅広く使用できる | PowerMacシリーズ、Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 60万円〜 | 91年4月 | − |
パーソナルCAChe | 〃 | 〃 | 三次元分子モデルの入力/編集、拡張MM2およびMM3/拡張ヒュッケル計算、計算結果の視覚化(立体視)ができる。計算化学の入門編 | 〃 | 20万円〜 | 〃 | − |
CACheサテライト | 〃 | 〃 | 三次元分子モデルの入力/編集、計算結果の視覚化ができる。計算はネットワーク上のCACheグループサーバー上で実行できる。CAChe ProjectLeaderを装備 | 〃 | 25万円〜 | 〃 | − |
Quantum CAChe | 〃 | 〃 | CACheワークシステムのProjectLeader以外のすべてのソフトウエアが使用可能。MOPAC、ZINDO、拡張MM2/MM3等の計算ができる | 〃 | 40万円〜 | 97年4月 | − |
配座探索CAChe | 〃 | 〃 | 安定な分子の配座構造を自動探索するための様々な機能を装備。精度の高い計算手法(DFT、ab initio)の初期配座の発生に使用できる | 〃 | 35万円〜 | 2000年11月 | − |
Ab initio CAChe | 〃 | 〃 | 分子力場法、分子動力学法、半経験的分子軌道法さらに密度汎関数法までをパッケージした精度の高い計算ができる | WindowsNT4.0/2000、XP | 60万円〜 | 2000年11月 | − |
CAChe Worksystem Pro | 〃 | 〃 | 分子力場法、分子動力学法、半経験的分子軌道法および密度汎関数法までをパッケージし、さらにQSAR、QSPRの解析に応用できる | 〃 | 80万円〜 | 2000年11月 | − |
CONFLEX | 〃 | 〃 | 配座空間探索プログラム(豊橋技術科学大学の大澤先生、後藤先生により開発)、拡張MMと組み合わせて使用(オプション) | PowerMacシリーズ、Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 15万円〜 | 99年9月 | − |
CACheグループサーバー | 〃 | 〃 | 各CACheシステムの計算サーバーとして、UNIXワークステーション上で拡張MM2およびMM3、MD、MOPAC、ZINDO、Dgauss等が実行できる | IBM RS/6000、SGIワークステーション | 100万円〜 | 92年4月 | − |
DGaussサーバー | 〃 | 〃 | 各CACheシステムの計算サーバーとして、UNIXワークステーション上でDFT密度汎関数法が実行できる | 〃 | 40万円〜 | 98年4月 | − |
CONFLEXサーバー | 〃 | 〃 | 各CACheシステムの計算サーバーとして、UNIXワークステーション上で配座空間探索プログラム(豊橋技術科学大学の大澤先生、後藤先生により開発)が実行できる | 〃 | 25万円〜 | 〃 | − |
CAChe Project Leader | 〃 | 〃 | 計算値と実験値等とのキャリブレーションをCACheシステム上で自動化できる。QSAR、QSPRの解析に最適。スプレッドシート形式で入力操作も簡単に行える。複数分子の自動連続計算の可能 | PowerMacシリーズ、Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | − | 94年1月 | − |
Bio CAChe | 〃 | 〃 | たんぱく質構造を簡易的に解析する為の計算化学ツール。分子力学計算による構造最適化や配座構造の自動探索が行える | Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 30万円〜 | 2003年5月 | − |
BioMed CAChe | 〃 | 〃 | 医薬分野に役立つ計算手法をそろえた計算化学ソリューション。安定な分子の配座構造を自動探索するための様々な機能を装備し、さらにQSAR、QSPRの解析に応用できる | 〃 | 70万円〜 | 2003年5月 | − |
BioMed CAChe ActiveSite | 〃 | 〃 | 医薬分野に役立つ計算手法をそろえた計算化学ソリューション。たんぱく質分子に対して分子軌道法計算が実行できるだけでなく、活性部位とリガンドの親和性のスコアリングやドッキングスタディが可能です | 〃 | 100万円〜 | 2003年7月予定 | − |
CAChe MASPHYC | 〃 | 〃 | BioMedCAChe シリーズのオプション機能。BioMedCAChe GUIから分子動力学計算が実行可能となる。AMBERパラメタ使用 | 〃 | 45万円〜 | 2003年7月予定 | |
ACD/Spectroscopy | 〃 | 加アドバンスドケミストリーデべロップメント | 分析機器(NMR,MS,UV-IRなど)からのデータを加工し、化学構造式と関連させてデータベース化を行い、構造式からNMRシフトを予測できるプログラム。ChemDrawやISISとの連携モジュールも用意されている | Windows98、NT、2000、XP | 78万4,000円〜 | 2002年3月 | − |
ACD/Physchem | 〃 | 〃 | 化学構造式から物性値(LogD,LogP,Pka,Solubility,Boiling Point)を予測するプログラム。ChemDrawやISISとの連携モジュールも用意されている | 〃 | 30万4,000円〜 | 2002年3月 | − |
ACD/Cromatography | 〃 | 〃 | HPLC,GCの測定条件をシミュレート、HPLC,GCのデータを加工、データベース化するプログラム | 〃 | 78万4,000円〜 | 2002年3月 | − |
ACD/Name | 〃 | 〃 | 化学構造式から化学名を生成するプログラム。ChemDrawやISISとの連携モジュールも用意されている | 〃 | 78万4,000円〜 | 2002年3月 | − |
Xminer | 〃 | 富士通 | 遺伝子・たん白質関連性探索支援システム。LocusLink、UniGeneをベースに独自に作製した遺伝子辞書から遺伝子間の関連性をマイニングするソフト | Windows2000/XP | 25万円〜 | 2003年4月 | − |
(仮称)MedScreen | 〃 | 富士通九州システムエンジニアリング | MedScreenは、従来から行ってきた薬理活性主体のIn Silico解析と同時に、ADME-Toxを同時に評価するための「インテグレーテッド高速/仮想インシリコスクリーニング」システムです。薬理活性と同時に、薬物動態や毒性に関する吸収、代謝予測、毒性予測等の問題を同時に評価することで、大量の化合物ライブラリから、ヒット化合物としての確率をあげるための母集団の絞り込み、さらにリード化合物の最適化へのアプローチを強力に支援します | サーバー:Windows2000、クライアント:InternetExplorer5.5以降 | 1,000万円〜 | 2003年9月 | − |
Tsar | 〃 | 米アクセルリス | データ処理(表作成)、統計処理、表示機能がすべて一つのシステムでできる構造活性相関プログラム。HanschとLeoの置換基データベース内蔵。ニューラルネット分析や毒性予測も可能 | SGIワークステーション、WindowsNT/2000、XP | − | 92年7月 | − |
Tsar3D | 〃 | 〃 | TSARに以下のプログラムを追加、VAMP(半経験的分子軌道計算)、ASP(静電性、疎水性、立体性について、分子の類似性を定量化する),Corina(二次元構造のファイルから三次元構造の座標を発生させる) | 〃 | 〃 | 92年7月 | − |
TOPKAT | 〃 | 〃 | 化合物毒性予測プログラム。分子構造式からデータベースをもとにQSTR手法により毒性値を予測する。発がん性、催奇形性、Ames、RatOralLD50等14種類の毒性予測モジュールで構成 | Windows98、NT4.0/2000、Me、XP | 〃 | 〃 | − |
DIVA | 〃 | 〃 | 大量データのトレンド解析プログラム。15万件以上の数のライブラリーを入力して、データのトレンドをみつけることを容易にする。トレンド解析、リード探索に様々な表示および解析ツールが用意されている | 〃 | 62万円 | 98年10月 | − |
RS3 Discovery | 〃 | 米アクセルリス | Oracleに高性能の化学構造式検索ルーチンを組み込んだOracleベースのクライアント/サーバ型化学情報管理システム | WindowsNT4.0、Sファミリ(Sun) | 800万円より | 96年1月 | − |
RS3 HTS | 〃 | 〃 | RS3 Discoveryをベースに開発されたHTS(HighThoughput Screening)データ管理システム。HTS業務を効果的に支援 | 〃 | 1,000万円より | 96年10月 | − |
RS3 IAB | 〃 | 〃 | RS3をベースに構築されたDBをブラウザーからアクセス可能にする開発支援ツール | 〃 | 450万円 | 2001年4月 | − |
GENETYX-MAC(Ver.12) | ゼネティックス | ゼネティックス | Macintosh版遺伝子解析ソフトウェア。マルチアライメント、分子進化系統樹作成、機能モチーフ検索、核酸配列自動結合など | Macintosh(OS]対応) | お問い合わせ下さい | 91年12月 | − |
バイオインターネット拡張キット | 〃 | 〃 | 電子メールホモロジー検索支援/プライベートデータベース構築 | MAC OS7.5.1以上 | 〃 | 96年8月 | − |
GENETYX-PDB(Ver.4) | 〃 | 〃 | プライベートデータベースソフトウェア 構築したDBに対してBLAST、FASTAホモロジーサーチや高速キーワードサーチ | Windows/MacOS] + JAVA2 | 〃 | 2000年5月 | − |
G-DRAW(Ver.1) | 〃 | 〃 | 出力整形ソフトウェア | Windows、MacOS]+JAVA2 | 〃 | 2001年12月 | − |
GENETYX Ver.6 | 〃 | 〃 | Windows版遺伝子解析ソフトウェア。マルチアライメント、分子進化系統樹作成、機能モチーフ検索核酸配列自動結合など | WindowsXP/Me/98、2000/NT4.0 | 〃 | 96年4月 | − |
ATGC(Ver.4) | 〃 | 〃 | シーケンスアセンブリソフトウェア。大量のフラグメント配列の結合処理。波形の信頼度を考慮したコンセンサス配列の決定 | 〃 | 〃 | 98年10月 | − |
EXONORER(Ver.2.1) | 〃 | 〃 | ゲノムシーケンスに対するエクソンの探索、解析支援ソフトウェア | WindowsXP/2000/NT4.0+JAVA2 | 〃 | 2001年3月 | − |
G-PROF(Ver.2) | 〃 | 〃 | 大量のDNA断片のクラスター解析ソフトウェア | WindowsXP/Me/98、2000/NT4.0、Macintosh | 〃 | 2001年12月 | − |
GENETYX-SV/R | 〃 | 〃 | 遺伝子解析ソフトウェアのクライアント/サーバー版 | サーバー:SUN/Linux、クライアント:Macintosh/Windows | 〃 | 94年3月 | − |
GENETYX-SV/DB | 〃 | 〃 | 核酸配列/蛋白質データベース検索ソフトウェアのクライアント/サーバー版 | 〃 | 〃 | 94年2月 | − |
ATGC-SV | 〃 | 〃 | シーケンスアセンブリソフトウェアのクライアント/サーバー版 | 〃 | 〃 | 99年3月 | − |
GENETYX-SQ/EX | 〃 | 〃 | ゲノム核酸配列自動結合ソフトウェア。大量のフラグメント配列の結合処理。波形の信頼度を考慮したコンセンサス配列の決定 | SUN | 〃 | 91年5月 | − |
GENETYXネットワーク版 | 〃 | 〃 | 遺伝子解析ソフトウェアのネットワーク版、1,3,5,10ライセンスセット | WINのみ、MACのみ、WIN、MAC混在 | 〃 | 2003年4月 | − |
ATGCネットワーク版 | 〃 | 〃 | シーケンスアセンブリソフトウェアのネットワーク版、1,3,5,10ライセンスセット | WINのみ | 〃 | 2003年4月 | − |
GENETYX-PDBネットワーク版 | 〃 | 〃 | プライベートデータベースソフトウェアのネットワーク版、1,3,5,10ライセンスセット | WINのみ、MACのみ、WIN、MAC混在 | 〃 | 2003年4月 | − |
DNASIS Pro | 宝酒造、エヌピーキャノン、DNAチップ研究所 | 日立ソフトウェアエンジニアリング | パソコンの初心者でもすぐに使える分かり易いインターフェイスと、データベース検索機能や制限酵素サイト探索機能などの豊富な機能を兼ね備え、15年間多くのユーザに親しまれ、世界中で1万本以上の販売実績を持つ。SNP解析支援機能等の新たな解析機能を追加。以下、各種オプション有。(1)ホモロジー検索(2)マルチプルアラインメント(3)DNASpace(4)Phred/Phrap(5)DBexpressII(6)GeneBrightIII | Windows98/Me、NT/2000/XP | 30万円〜 | 2001年11月 | − |
SPBIO | DNAチップ研究所 | 〃 | バイオチップ作成装置 | WindowsNT | 1200万円 | 99年8月 | − |
CRBIOUe | 〃 | 〃 | バイオチップ読取装置 | Windows2000 | 800万円 | 2002年4月 | − |
CHBIO+ | 〃 | 〃 | バイオチップハイブリダイゼーション反応用恒温槽 | Windows98 | 70万円 | 2000年1月 | − |
HyperGeneシリーズ | 〃 | 〃 | 汎用DNAチップ。Human,Human HouseKeeping Gene,Rat -Liver-,Yeast chip有。 | − | − | 2002年3月 | − |
DNASIS Array Database | 〃 | 〃 | バイオチップ情報処理ソフトウエア | WindowsNT | 500万円 | 99年12月 | − |
FMBIOV | 日立ソフトウェアエンジニアリング | 〃 | 蛍光バイオイメージアナライザー。蛍光物質で標識されたDNAやたん白質を直接読み取り、解析を行うシステム | Windows2000 | − | 2002年3月 | − |
DNASIS GeneSolution | 〃 | 〃 | バイオラボラトリーソリューションサービス。研究機関ネットワーク構築、カスタマーサポートなど、遺伝子実験施設向けシステムのサポート | − | − | 2002年6月 | − |
Luminexシステム | 〃 | ルミネックス | 蛍光マイクロビーズアレイシステム。それぞれ異なる色に着色された100種類のポリスチレン製微粒子を使用し、1本のマイクロチューブ内で最大100件の解析を同時に行うシステム。Luminex 100,Luminex XYP,Luminex SDのセット | Windows98 | 980万円 | 2000年10月 | − |
Multiplex Antibody Kits | 〃 | バイオソース | Luminex用サイトカインアッセイキット。ヒト、マウス各種有 | − | − | 2001年9月 | − |
MasterPlex QT | 〃 | ミライバイオ | Luminex専用定量解析ソフトウェア | Windows98/Me、NT/2000/XP | − | 2002年3月 | − |
Human GENOMESpace | 〃 | 日立ソフトウェアエンジニアリング | ヒトゲノム情報閲覧・検索ソフトウェア。膨大なヒトゲノム情報を、ユーザの下で容易に閲覧・検索可能 | Windows98以降 | 30万円、15万円(アカデミック) | 2000年4月 | − |
SEQUENCHER | 〃 | 米ジーンコード | DNAシーケンスアセンブルソフトウェア。各社のDNAオートシーケンサに対応 | Macintosh、Windows98等 | 57万円(Mac版)、75万円(Win版) | 95年9月 | − |
BioSearcher | 日本ヒューレット・パッカード | 日本ヒューレット・パッカード | 独自に開発したMitakeSearch を全文検索エンジンとして用い、大量のゲノムDBの高速な検索を可能にした完全64bit対応ソフトウェア | サーバー:Alpha、Tru64UNIX V5.1以上 | 480万円から(アカデミック向け価格設定あり) | 2001年1月 | − |
BioFinder | 〃 | 〃 | ブラウザからBLASTのパラメータを簡単に設定・起動し、その結果を配列毎のアライメントとして見られるるだけでなく、直感的な画像として見る事が可能なビューアー | サーバー:Alpha、Tru64UNIX V5.0a以上 | 無償 | 2000年12月 | − |
BioCollector | 〃 | 〃 | インターネット上のバイオデータを自動的にローカルサイトに取得、更新するソフトウェア | AlphaServer(Tru64UNIX5.1a以上)またはProliant(Redhat7.2以上)、マルチCPUを推奨 | 98万円から(アカデミック向け価格設定あり) | 2002年6月 | 長浜バイオ大学、独立行政法人製品評価技術基盤機構他 |
ATOMS | ヒューリンクス | 米シェイプ | 分子、高分子、結晶を含むあらゆるタイプの原子構造を3Dで描画する。日本語マニュアル付 | Windows、Macintosh | 7万5,000円 | − | − |
AssayZap | 〃 | 米バイオソフト | Assazyから生成されたデータの分析および蓄積を自動化するソフトウェア | 〃 | 6万8,000円 | − | - |
Atlantis 2000 | 〃 | 米シグマソフト | グラフ機能と計算機能を兼ね備えたプレゼンテーションツール。2D/3Dのグラフ作成など | Windows | 3万5,500円 | − | − |
CalculationCenter2日本語版 | 〃 | 米ウルフラムリサーチ | 強力な演算機能と簡単で直感的なユーザインターフェースを結び付けた演算ソフトウェアで,技術的な問題に素早い回答を求めるプロフェッショナルに最適のツール | Windows、Macintosh | 4万9,000円 | − | − |
CalcuSyn | 〃 | 米バイオソフト | 治療薬の組み合わせや投薬量など投薬治療にとって非常に重要な解析を行う | Windows | 8万6,000円 | − | − |
CART | 〃 | 米サルフォードシステム | この2進木解析ソフトを使用すれば、経験的な分類と予測を統計モデルにした分類や予測が簡単に行える | Windows、UNIX、Linux | 要問合せ | − | − |
Crystal Kit | 〃 | 米トータルレゾリューション | 粒子間の結合関係や接触面、軸等を設定すれば、非常に短時間であらゆる結晶体の構造を作成できるソフト | Macintosh | 39万6,000円 | − | − |
CS Chem3D Ultra | 〃 | 米ケンブリッジソフト | 高品質な分子表面グラフィックや高度な計算を行うパッケージ。Gaussian との統合により、半経験的な特性のモデリングも可能 | Windows、Macintosh | 要問合せ | − | − |
CS ChemDraw Ultra/Pro/Std | 〃 | 〃 | 化学構造式描画ソフト。構造式の描画以外にも研究者が必要とする、NMR スペクトルの予測、複数のドキュメントの作成、立体化学式表示、Name=Struct機能、ポリマー描画などの機能が搭載されている | 〃 | 〃 | − | − |
CS E-Notebook Ultra | 〃 | 〃 | 電子実験ノート。画像データやMS Excel、MS Word等のファイルをまとめて管理でき、化学構造式による過去のノートへの検索が可能 | Windows | 〃 | − | − |
CS ChemOffice Ultra/Pro | 〃 | 〃 | 化学者のニーズを満たすChemDraw、Chem3D、E-Notebookを統合した製品。描画した構造式の3D変換やDBの作成、Webへの発行を行える | Windows、Macintosh | 〃 | − | − |
CS ChemOffice WebServer BASE 5クライアント | 〃 | 〃 | 化学構造式を含むデータベースを構築するためのアプリケーション。クライアントは、webブラウザから、ChemDrawのプラグインにより、部分構造検索等の検索が行える他、Additional Serverにより、webブラウザからデータベースの管理も可能に | Windows | 〃 | − | − |
The Merck Index | 〃 | 〃 | 電子版メルクインデックス | − | 〃 | − | − |
EnzPack | 〃 | 米バイオソフト | Wilkinsonの非直線回帰によってデータを解析し、酵素の計算と解析を行うソフト | Windows | 4万5,000円 | − | − |
FlexPro6.0日本語版 | 〃 | 独ヴァイサンアンドカンパニー | 大規模データ解析・ビジュアライズソフト。計測機器で測定した大規模データを解析し、データ収集からプレゼンまでを一連の流れとしてこなす | 〃 | 8万5,000円から | ||
Gaussian 03 & 03W&03M | 〃 | 米ガウシアン | 広範囲にわたるモデリングおよび半経験的モデルをサポートした汎用量子化学計算プログラム。CS Chem3Dが描画クライアントになる | Windows、UNIX、Linux、MacOSX | 要問合せ | − | − |
GaussView 3.0 | 〃 | 〃 | Gaussian計算結果の視覚化ツール | Windows、UNIX、Linux、MacOSX | 〃 | − | − |
Gene Construction Kit 2.5 | 〃 | 米テキストコ | 複雑なクローニング プロジェクトを立案し、遂行するソフトウェア | Windows、Macintosh | 38万6,000円 | − | - |
Gene Inspector | 〃 | 〃 | 研究者用電子ノートブック、配列解析パッケージおよびイラストレーション ツールを兼ね備えるソフトウェア | Macintosh | 48万円 | − | - |
IGOR Pro 4.0 日本語版 | 〃 | 米ウエーブメトリックス | 高速にインタラクティブに大量データを解析し、視覚化する究極の解析ツール | Windows、Macintosh | 16万円 | − | − |
KaleidaGraph 日本語版 | 〃 | 米シナジー | シンプルなグラフの作成から回帰曲線やエラーバーを適用するような複雑なグラフの作成まで、非常に簡単な操作で実行できるグラフ作成ソフト | 〃 | 4万6,000円 | − | − |
KELL | 〃 | 米バイオソフト | 加重非直線回帰、反復回帰を用い飽和、拮抗の平衡を解析あるいは、結合や非結合の定数率を決定する放射線配位子の結合解析パッケージ | Windows | 11万円 | − | − |
Linda | 〃 | 米サイエンティフィックコンピューティングアソシエイツ | パラレル計算プログラミングツール | UNIX、Linux、MacOSX | 要問合せ | ||
Mac Tempas | 〃 | 米トータルレゾリューション | マルチスライス計算、回折パターン、任意の方向に対するセルユニットの自動計算他の機能を搭載するTEMイメージシミュレーションソフト | Macintosh | 88万円 | − | − |
Mathematica 4.2 日本語版 | 〃 | 米ウルフラムリサーチ | あらゆる分野で使用できる汎用の数学処理ソフトウェア。電気、機械、化学、金融・証券等のパッケージあり | Windows、Macintosh、UNIX、Linux | Windows/Macintosh:45万円、UNIX/Linux-英語版:要問い合わせ | − | − |
webMathematica | 〃 | 〃 | webサイト上で科学技術計算ができるソフト※1年間のサイトライセンス契約の価格 | 〃 | 要問合せ | ||
gridMathematica | 〃 | 〃 | 複数のCPUを使用した並列処理計算ができるソフト | 〃 | 〃 | ||
NameIt | 〃 | 米トリニティソフトウエア | IUPAC命名法に基づいて体系的に構築される学名のネーミングを行うソフト | Windows | 3万6,000円 | − | − |
NeuroSim | 〃 | 米バイオソフト | 神経生理学の分野の研究に非常に有益な洞察を提供できるシミュレーションソフト | 〃 | 6万2,000円 | − | − |
Paradise | 米サイエンティフィックコンピューティングアソシエイツ | パラレル計算プログラミングツール | UNIX、Linux、MacOSX | 要問合せ | |||
PeakAlyze | 〃 | 米バイオソフト | スペクトログラフ、クロマトグラフのデータ、ピークデータをパワフルに解析 | Windows | 8万6,000円 | − | − |
Peak Fit | 〃 | 米シスタット | 分光器やクロマトグラフィーのデータを解析するために使用するソフト | 〃 | 13万円 | − | − |
QuantiScan | 〃 | 米バイオソフト | スキャナーで読み込んだ画像を元に、ゲル解析、TCLプレート解析、オートラジオグラム解析 | 〃 | 11万円 | − | − |
SHAPE | 〃 | 米シェイプソフト | 結晶の表面組織や結晶断面を描画する。多くの単結晶、双晶を描画できる。日本語マニュアル付 | Windows、Macintosh | 5万5,000円 | − | − |
SigmaPlot 8 | 〃 | 米エスピーエスエス | 科学者、エンジニア必携の技術データ解析&グラフ作成ソフト。日本語PDFマニュアル付 | Windows | 12万8,000円 | − | − |
SigmaPlot Enzyme Kinetics Module | 〃 | 〃 | 酵素及び蛋白質に関するデータを素早く分析し、詳しくレポートする回帰分析、グラフ作成用のマクロパッケージ | 〃 | 8万8,000円 | ||
SigmaScan Pro | 〃 | 〃 | 特殊な認識機能を用いて、デジタルのイメージ画像を高速かつ正確に測定、解析する | 〃 | 24万6,000円 | − | − |
SigmaStat 3 | 〃 | 〃 | データの取扱いから実行すべきテストの推奨、仮説検証、適切なテストの実行と結果の解釈まで | 〃 | 11万円 | − | − |
Stat-100 | 〃 | 米バイオソフト | 記述統計、パラメトリック&ノンパラメトリック検定、グラフ作成、画像およびデータ変換を行う総合統計解析パッケージ | 〃 | 4万5,000円 | − | − |
Stat-200 | 〃 | 〃 | 記述統計、パラメトリック&ノンパラメトリック検定、グラフ作成、画像およびデータ変換を行う総合統計解析パッケージ | 〃 | 8万6,000円 | − | − |
SynTree | 〃 | 米トリニティソフトウエア | 複雑な合成を探求する独自のツール。データベースから可能性のある全ての先駆物質を表示 | Windows、Macintosh | 4万4,000円 | − | − |
SYSTAT10.2 | 〃 | 米SYSTAT | 探索的なデータ解析が行える科学者、研究者、エンジニア必携の統計解析ソフト | Windows | 19万8,000円 | − | − |
TableCurve 2D | 〃 | 〃 | 1つの製品でパワフルな計算機能と回帰分析機能を合せ持つソフト | 〃 | 11万円 | − | − |
TableCurve 3D | 〃 | 〃 | パワフルな計算機能と回帰分析機能を合せ持つソフト。3Dのグラフィカルなプロットの作成が可能 | 〃 | 11万円 | − | − |
UnGraph | 〃 | 米バイオソフト | スキャナーで読み込んだグラフを解析し、XY座標のデータを任意の精度で認識する | 〃 | 8万6,000円 | − | − |
UNISTAT | 〃 | 米ユニスタット | ノンパラ検定、回帰、分散、クラスタ、判別、因子分析、時系列、QC、生存分析、フーリエ解析など様々な解析を備えた統計解析ソフト | 〃 | 19万5,000円 | − | − |
VIBRATZ | 〃 | 米シェイプソフト | 原子価力定数や Urey-Bradley 力場定数を利用して、分子や結晶の基準座標計算をする | Windows、Macintosh | 7万5,000円 | − | − |
GREEN | 医薬分子設計研究所 | 医薬分子設計研究所 | 対話的ドッキングシステム。結合部位環境の表示、リアルタイムの相互作用エネルギー計算、リガンド構造モデリングなどの機能を搭載 | SGI | 500万円 | 1995年4月 | 約20本 |
LEGEND | 〃 | 〃 | de novoリガンド設計プログラム。蛋白質結合部位に適合するリガンド分子を、乱数と力場に基づき自動生成 | SGI、Linux | 700万円 | 1995年4月 | 約10本 |
MOLEDIT | 〃 | 〃 | 分子モデリングプログラム | SGI | 200万円 | 1995年4月 | 約10本 |
Key3D | 〃 | 〃 | 化学構造式からの三次元構造生成プログラム。MMFF力場に基づく高精度な構造生成と高い変換率が特徴。ライブラリデータの連続処理も可能 | SGI、Linux | 600万円 | 1999年12月 | 約5本 |
KeyMolnet | 〃 | 〃 | 生体分子・遺伝子・疾患・医薬の情報戦略プラットホーム。文献調査に基づく信頼度の高いコンテンツを搭載し、任意の項目間の関係をネットワーク検索可能。DNA chip、プロテオーム等のデータ解析にも対応 | Linux(サーバー)、Windows(クライアント) | 3,500万円(同時利用5ユーザーの年間利用料、更新・保守含む) | 2003年4月 | 約5本 |
KeyRecep | 〃 | 〃 | 分子重ね合わせ法に基づくHTSヒット化合物の解析システム。分子形状・水素結合性・疎水性等に基づく高精度な分子重ね合わせが可能。化合物分類・構造活性相関解析・データベース検索などの機能も搭載 | SGI、Linux | 1,500万円から(予定価格) | 2003年後半を予定 | − |
JAGUAR | インフォコム(旧:帝人システムテクノロジー) | 米シュレーディンガー | Pseudospectral法アルゴリズムにより高い精度と高速な計算を実現した新世代ab-initio量子化学計算プログラム | SGI、IBM、HP、Compaq Digital UNIX、PC-Linux、SUN | お問い合わせ下さい | 96年 | − |
pKa Predictor | 〃 | 〃 | JAGUAR拡張モジュール。Ab-initio法により非経験的にpKaを算出 | 〃 | 〃 | 99年 | − |
MacroModel | 〃 | 〃 | Prof. Stillらにより開発された分子設計支援システム。有機・生体分子に最適化された力場パラメータと強力な計算・解析機能 | 〃 | 〃 | 99年 | − |
MINTA | 〃 | 〃 | MacroModel拡張モジュール。高速かつ高精度に自由エネルギーを算出 | 〃 | 〃 | 99年 | − |
FirstDiscovery: Impact | 〃 | 〃 | FirstDiscoveryモジュール: 生体高分子(タンパク、核酸等)向け分子力学、動力学プログラム | SGI、PC-Linux | 〃 | 2001年 | − |
FirstDiscovery: Glide | 〃 | 〃 | FirstDiscoveryモジュール: リガンド-レセプターサイトドッキング計算モジュール | 〃 | 〃 | 2001年 | − |
FirstDiscovery: Liaison | 〃 | 〃 | FirstDiscoveryモジュール: リガンド-レセプターサイトドッキング計算モジュール | 〃 | 〃 | 2001年 | − |
FirstDiscovery: Qsite | 〃 | 〃 | FirstDiscoveryモジュール: JAGAURとOPLS-AA力場によるQM/MMプログラム | 〃 | 〃 | 2001年 | − |
QikProp | 〃 | 〃 | 薬物物性予測ソフトウェア。3次元構造式からCaco-2 Cell permeability, Blood-Brain barrier permeability, 溶解度、LogPなどを予測する | WIndows95、98、NT、2000、SGI、IBM、HP、Compaq Digital UNIX、PC-Linux、SUN | 〃 | 2000年 | − |
ADME Boxes | 〃 | カナダ・ファルマアルゴリズムス | ADME Boxesは、手間の掛かるデータ分析と入念に作り上げたエキスパートモデルに基づいて ”生体に関わる物性”を評価するソフトウェア。入力した2次元構造から各モジュールの評価結果表示のほか、文献データとリファレンスを伴ったトレーニングセットから最も類似した構造を5つまで即座に表示する。評価物性種はPhysico-chemical properties、Aqueous Solubility、Human Intestinal Permeation、Acute Toxicity、Ionization、P-gp substrate specificity | WindowsNT/2000、XP | 〃 | 2003年5月 | − |
QSAR Builder | 〃 | 〃 | QSAR Builderは、明白に定義されたルール(規則)に基づく決まりごととユーザが開発したフラグメンテーション・シーケンス(Fragmentation sequences)を利用して、物性や活性の解析にフラグメンタル手法(Fragmetal methods)を適用させることができる。フラグメンタル手法は、特定のリガンド/ファーマコフォー相互作用、あるいは生物活性と関係する同属シリーズを研究する場合の、より小さなデータセットに対しても有効に利用することができる | WindowsNT/2000 | 〃 | 2003年5月 | − |
Algorithm Builder | 〃 | 〃 | 定量的構造活性相関(QSAR)、定量的構造物性相関 (QSPR)及び構造活性相関(SAR)のモデルを構築し、これら手法をユーザ独自の予測アルゴリズムに変換させるソフトウェア・システム | 〃 | 〃 | 2003年5月 | − |
GastroPlus | 〃 | 米シミュレーションプラス | 薬物経口投与時の各消化管部位での吸収や挙動を予測。pHによる吸収の変化や投与薬物製剤の物性も考慮でき、コントロールリリースを含む製剤研究にも応用可能 | Windows95/98、NT/2000、XP | 〃 | 98年 | − |
GastroPlus:Optimaization Module | 〃 | 〃 | GastroPlus のシミュレーション結果を実験値に最適化します。コントロールリリースプロファイルや製剤パラメータを調整することで目標とする血中濃度変化データを得るための製剤情報を求めることが可能 | 〃 | 〃 | 2000年 | |
GastroPlus:Metabolism and Transporter Module | 〃 | 〃 | 薬物代謝やトランスポータを加味した吸収や挙動を予測する | 〃 | 〃 | 2001年 | |
GastroPlus:PKPlus Module | 〃 | 〃 | 静脈注射血中濃度変化データから、3−コンパートメントモデルまでの薬物動態パラメータを求めることができる | 〃 | 〃 | 2001年 | |
GastroPlus:IV-IV Correlation Module | 〃 | 〃 | in vitro の溶解実験データと、GastroPlus で解析したin vivo のリリースや溶解を比較する | 〃 | 〃 | 2001年 | |
GastroPlus:PDPlus module | 〃 | 〃 | Pharmacodynamics用解析モジュール | 〃 | 〃 | 2002年 | |
QMPRPlus | 〃 | 〃 | 化学構造(2D/3D) から膜透過係数(ヒトとラット)、LogP、溶解度、拡散係数、BBB透過係数、タンパク結合、Volume Distributionを予測 | 〃 | 〃 | 98年 | − |
QMPRPlus:MDCK Module | 〃 | 〃 | QMPRPlusオプション:MDCK膜透過率を予測 | 〃 | 〃 | 2001年 | |
SKIN-CAD | 〃 | イーハイブ・コミュニケーション | 経皮吸収予測ソフトウェア | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
Debra 5 | 〃 | 英ラボロジック | FDA 21 CFR Part 11に準拠したADME試験用情報管理システム | Windows95、98、Me、NT4.0、2000、XP | 2003年 | ||
Pallas pKalc | 〃 | ハンガリー・コンピュードラッグ | 分子構造からHammettとTaftの計算式によりpKa値を予測 | Windows95/98、NT/2000 | 〃 | 99年 | − |
Pallas PrologP | 〃 | 〃 | 分子構造からRekkerフラグメント法、Broto原子アプローチ法、Ghose法の3つの方法を組み合わせることによりLogP値を予測 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Pallas Combi | 〃 | 〃 | Pallas Combiは pKalc、 PrologP、 PrologDの3つの構成。ProLogDはPKalc、ProLogPにより計算されたpKaとLogPからLogDを予測 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Pallas EluEx | 〃 | 〃 | C18逆相カラムを使用する研究者に最適な測定条件を予測。2回の測定結果の入力により、溶媒混合比に対するRs値の変化プロットを表示 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Pallas Hazard Expert | 〃 | 〃 | 発癌性、変異原性、催奇形成、膜刺激性、神経毒性といった化合物の異なる毒性の影響予測を行う | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Pallas Metabol Expert | 〃 | 〃 | 哺乳類および植物内での反応ルールに基づくDB搭載。哺乳類や植物の代謝物の構造を予測 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Pallas plug-in for ISIS | 〃 | 〃 | ISIS/BaseからPallas Combi(pKa/logP/logD)の計算を行う、ISIS/BaseへのAdd-Inソフトウェア | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
Emil | 〃 | 〃 | 医・農薬品の膨大な構造を元にリード化合物から効果的にアナログ構造を発生させるライブラリーデザインツール | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
AntiBase | 〃 | 〃 | 微生物・酵母・かび等から抽出された天然化合物データベース | Windows95/98、NT | 〃 | − | − |
MODDE | 〃 | スウェーデン・ユーメトリックス | 実験のデザインと最適化を行う実験科学者向けのソフト。多変量解析手法のMLRおよびPLS法を用いて実験条件と結果の最適化を行う。混合物の配合条件とプロセスの条件を同時に最適化 | 〃 | 〃 | − | − |
SIMCA-P | 〃 | 〃 | 科学者・技術者のためのデータマイニングツール。 多変量解析手法は主成分分析およびPLS法が利用可能。多変量解析を利用したプロセス診断も可能 | 〃 | 〃 | − | − |
Mascot | 〃 | 英マトリクスサイエンス | Massスペクトルデータからタンパク質を同定するためのシステム。参照データベースの自動更新機能まで含む、ハイスループット対応 | サーバー:Windows NT4.x、2000、Linux、IRIX、Tru64-Unix | 〃 | 2000年 | − |
preXence | 〃 | インフォコム | Mascotから出力される検索結果のデータベース化と、管理・解析が可能。 | Windows2000 | 〃 | 2003年1月 | − |
PEAKS | 〃 | カナダ・バイオインフォマティックスソリューションズ | Massスペクトルデータから未知のタンパク質配列を決定するde-Novoシーケンス解析ソフトウェア。 | Windows2000、XP | 〃 | 2003年5月 | − |
GeneData | 〃 | スイス・ジーンデータ | ゲノムからプロテオームまでトータルにサポートする、大量/ハイスループット処理対応のシステム。RDB環境をもち、トータルでのゲノム/プロテオーム データの管理が可能 | サーバー:Unix-OS, クライアント:全機種(Javaサポート) | 〃 | 2000年 | − |
GeneData:Phylosopher | 〃 | 〃 | 比較ゲノム解析システム:完全長ゲノム情報をもとに、ターゲットタンパク質の絞り込み、未知領域の機能予測が可能。パスウェイ解析、発現データとの連携など、各種の解析機能をもつ | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
GeneData:Expressionist | 〃 | 〃 | 遺伝子発現データ解析システム:マイクロアレイ、DNAチップ、フィルターなどの各種発現データを規格化した上で、各種統計手法による統一的な解析が可能 | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
GeneData:Impressionist | 〃 | 〃 | タンパク質発現データ解析システム:2次元電気泳動のデータの解析。各種統計手法をもつ | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
GeneData:Screener | 〃 | 〃 | 化合物スクリーニングデータ解析システム | 〃 | 〃 | 2003年 | − |
BioNumerics | 〃 | ベルギー・アプライドマス | バイオインフォマティックス統合システム:電気泳動、ガスクロ、HPLC、分光光度計曲線等の波形データ、塩基/アミノ酸配列データ、マトリックスデータ、酵素/代謝反応実験のプロファイリングなど、各種実験データ入力。階層的/非階層的クラスタリング、多変量解析などの各種統計手法。RDB対応 | Windows NT以降 | 〃 | 2000年 | − |
2D Expert | 〃 | 〃 | 2次元電気泳動解析プログラム(近日リリース予定) | 〃 | 〃 | 2003年 | |
GelComparII | 〃 | 〃 | 一次元電気泳動データ解析システム: | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
GeneMaths | 〃 | 〃 | 遺伝子発現データ(DNAチップ・マイクロアレイ)解析システム。階層的/非階層的クラスタリング、多変量解析などの豊富な各種統計手法。RDB対応 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
KODON | 〃 | 〃 | 核酸配列解析システム: | 〃 | 〃 | 2002年 | − |
Geneseq | 〃 | 英ダウエント | 全世界の公開特許、登録特許中の核酸、たん白質の配列を独自にコレクションしたDB | PC:全シリーズ、サーバー:全シリーズ | 〃 | 1995年 | − |
Geneseq FASTAlert | 〃 | 〃 | 全世界の公開特許、登録特許中の核酸、たん白質の配列を独自にコレクションしたDBの速報版 | 〃 | 〃 | 2000年 | − |
Lasergene | 〃 | 米DNAスター | 多機能遺伝子配列解析ソフトウエア | Windows95/98/NT、Macintosh | 〃 | 97年2月 | − |
SWISS-PROT | 〃 | スイス・ジーンバイオ | アミノ酸配列データベース | − | 〃 | − | − |
OmniViz | 〃 | 米オムニビズ | 可視化によるデー玉イニング、テキストマイニング、統合型意思決定支援システム | WindowsNT/2000、SUN、PC-Linux | 〃 | 2003年5月 | − |
PathwayAssist | 〃 | 米アリアドネジェノミックス | パスウェイ情報可視化・描画ツール | Windows2000、XP | 〃 | 2003年2月 | − |
MedScan | 〃 | 〃 | MEDLINEからタンパク質機能・パスウェイ情報など抽出する自然言語処理プログラム | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Index Chemicus | トムソンISI、トムソンダウエント | 米トムソンISI | 世界の著名な化学雑誌に発表された新規化合物に関する情報。化学構造式とサマリー、発表論文の書誌データと抄録を収録。化学構造式からもテキストからも検索可能。1991年以降の170万化合物を収録しており、毎年約20万件追加される。毎月更新 | テープ、FTP (ISIS/ORACLE) | サイトワイド契約。利用者数による見積もりベース | 95年 | − |
Current Chemical Reactions | 〃 | 〃 | 世界の著名な化学雑誌と米国特許を情報源とする最新の反応に関する情報。反応のダイヤグラム、発表論文の書誌情報、抄録などを収録。1840年以降の75万件のデータを収録。毎年4万5千件以上のデータが追加される。年2回更新(オプションで毎月、年4回も可能) | テープ、FTP (ISIS/REACCS、RD File) | 〃 | 86年、97年 | − |
ISI Web of Science | 〃 | 〃 | 1945年からの8,500以上の重要学術雑誌から書誌情報を収録している文献のデータベース。引用文献情報も搭載されているので、文献の引用回数を調べたり、引用文献をたどって研究の発展や経過を調べたりすることができる。検索結果のメールによるアラーティング、雑誌のフルテキストや外部のデータベースへのリンクの機能もある。最新版のWeb of Science v6で、Current Chemical Reactions(反応データベース)とIndex Chemicus(化合物データベース)が含まれ、構造式の検索と表示が可能となった | WEB環境があれば利用可。検索ソフトは無償提供(インターネット) | 〃 | 1997年 | − |
NM-SPEC2 (SpecMan、NMR-SAMS) | 日本電子 | 米スペクトラムリサーチ | NMRのスペクトルから平面構造を解析する作業を補助するソフトウェア。1D,2Dのスペクトルを読み込みピーク検出を行うSpecManと、ピークテーブルから部分構造を作り、この組み合わせで全体構造を提起するNMR-SAMSとの組み合わせで使う | Windows98、NT4.0/2000/XP | 200万円(3年ライセンス付き) | 2000年6月 | − |
ALICE2 for Windows | 〃 | 日本電子データム | NMRデータ処理(1,2次元対応)プログラム。自動処理機能が充実し、簡単にNMRチャートを得ることができる。処理結果を他のアプリケーションの引渡し、レポート作成や統計解析が容易。新たにJ couple、2D correlation等の解析機能が追加された。 | Windows98/Me、NT4.0/2000/XP | 詳細はお問い合わせ下さい | 94年 | − |
KnowItAll NMR(ノウ・イット・オールエヌエムアール)アナリティカルシステム | 日本電子データム | 米バイオ・ラッドラボラトリーズ | サドラーの保有するNMRスペクトルデータ13Cを350,000件,1Hを18,000件を検索することができるデータベースは年間契約。ユーザーデータベース構築機能もオプションでつけられる | 〃 | 初期価格176万円(1年ライセンス付 次年度DB80万円) | 2001年 | − |
SpecInfo v4 | 〃 | 独クレオン・ラボコントロール | 化合物の構造決定のサポートを行う統合化スペクトルDB。独BASF社が蓄積したデータを含むほか、自社DB構築機能も充実 | SUN、WindowsNT4/2000 | 290万円〜 | 96年 | − |
Spectacles XS | 〃 | 〃 | SpecInfoのPCクライアント。検索・NMRスペクトル予測・構造エディター・データベース構築機能の他、FTや位相補正、ピークピックなど | Windows98、NT4/2000/XP | 同上に含む | 99年 | − |
SpecSurf | 〃 | 〃 | SpecInfoのWebサーバー。ブラウザーソフトからSpecInfoの機能が利用できる | Netscape Navigator、Internet Explore | 要別途ライセンス | 2000年 | − |
CACheワークシステム | 〃 | 富士通 | 三次元(立体)分子計算モデリングシステム。三次元分子モデルの入力/編集およびMOPAC、ZINDO、拡張MM2およびMM3等の計算ができ、反応性の予測、遷移状態探索、QSARへの応用等幅広く使用できる | PowerMacシリーズ、Windows98、NT、2000、XP | 210万円 | 93年4月 | − |
パソナルCAChe | 〃 | 〃 | 三次元分子モデルの入力/編集、拡張MM2およびMM3/拡張ヒュッケル計算、計算結果の視覚化(立体視)ができる。計算化学の入門編 | 〃 | 70万円 | 93年4月 | − |
Quantum CAChe | 〃 | 〃 | CACheワークシステムのProjectLeader以外のすべてのソフトウエアが使用可能。MOPAC、ZINDO、拡張MM2/MM3等の計算ができる | 〃 | 140万円 | 93年4月 | − |
CONFLEX | 〃 | 〃 | 配座空間探索プログラム(豊橋技術科学大学の大澤先生、後藤先生により開発)、拡張MMと組み合わせて使用(オプション) | 〃 | 50万円 | 99年 | − |
CAChe Project Leader | 〃 | 〃 | 計算値と実験値等とのキャリブレーションをCACheシステム上で自動化できる。QSAR、QSPRの解析に最適。スプレッドシート形式で入力操作も簡単に行える。複数分子の自動連続計算の可能 | 〃 | CACheワークシステムに含む | 94年 | − |
ACD/NMR-1D | 〃 | 加アドバンスドケミストリデベロップメント | 1D-NMRのデータを加工し、ケミカルシフトの予測をする。化学構造式と関連させてデータベース化を行い、構造式からNMRシフトを予測できるプログラム。ChemDrawやISISとの連携モジュールも用意されている。 | Windows98、NT、2000、XP | 300万円〜 | 2003年 | − |
ACD/NMR-DB | 〃 | 〃 | Aldrich NMR スペクトルデータ、13C、1H各々15,000件。 ACD/NMR-1Dに追加のオプション。 | 〃 | 50万円〜 | 2003年 | − |
ACD/NMR-2D | 〃 | 〃 | 2D-NMRスペクトルの処理、2Dスペクトルの予測。 ACD/NMR-1Dに追加のオプション。 | 〃 | 160万円〜 | 2003年 | − |
GRAMS32/V6 | 〃 | 米ギャラクティック | 主に、IR、UV、RAMANなどのスペクトルデータを対象とし、豊富なパラメータを持って、波形分離を特長とする各種スペクトル処理が出来ます。主要メーカのスペクトルおよびテキスト形式のものデータ変換が可能 | 〃 | 25万円〜 | 95年 | − |
MS-DXNQNT(DioK) | 日本電子 | 日本電子 | 高分解能SIM法で測定sれたダイオキシンなどの異性体を含むクロマトグラムデータから定量演算を行なう | 〃 | お問い合わせください | 1998年6月 | − |
MS-MSEQ | 〃 | CIGB(キューバ) | アミノ酸一次構造解析支援プログラム | 〃 | 〃 | 1997年9月 | − |
MS-MSEQ/PSD | 〃 | 〃 | 蛋白質同定支援プログラム | 〃 | 〃 | 2000年3月 | − |
MS-DECONV | 〃 | 日本電子 | ESIモードで測定された多価イオンマススペクトルに対してデコンボリューション演算を行ない、親イオンのプロファイルを求め、その質量を推定する | 〃 | 〃 | 2001年3月 | − |
MS-46030W7 | 〃 | Palisade | 第7版マススペクトルライブラリーデータベース(Wiley's Registry of Mass Spectral Database)と検索ソフト | 〃 | 〃 | 2002年3月 | − |
MS-46030W7N | 〃 | 〃 | 第7版NIST付きマススペクトルライブラリーデータベース(Wiley's Registry of Mass Spectral Database with NIST)と検索ソフト | 〃 | 〃 | 2002年3月 | − |
J-OCTA | 日本総合研究所 | 日本総合研究所 | ミクロ〜メソ〜マクロ領域での高分子材料設計、マイクロプロセス設計に関わる統合シミュレーション環境で、ナノ複合材料設計、燃料電池設計、コーティング解析、バイオMEMS設計などに応用可 | Windows2000/XP、Pentium3-700MHz以上、メモリ256MB以上、HD1.5GB以上、OpenGLに対応したドライバソフト、グラフィックカードが必要 | 800万円(標準構成) | 2003年4月 | 8システム |
CNMR Predictor | エルエイシステムズ | 加ACD | 13CNMRスペクトルの予測。170万件の化学シフト値を基にスペクトルを予測。MDL社ISIS/Base、ISIS/Drawと連携可能 | Windows | 104万円 | − | − |
HNMR Predictor | 〃 | 〃 | 1HNMRスペクトルの予測。120万件の化学シフトと32万件の結合定数からスペクトルを予測。ISISから利用可能 | 〃 | 104万円 | − | − |
LogP DB | 〃 | 〃 | 中性分子のオクタノール/水の分配係数(LogP値)予測。約14,800件の化合物の構造と実験LogP値を登録した内部データベース付属。ISISから利用可能 | 〃 | 46万4千円 | − | − |
pKa DB | 〃 | 〃 | 弱酸の解離定数の予測。15,900件の構造と 31,000件に及ぶ実験値の内部データベースを附属。ISISから利用可能 | 〃 | 110万4千円 | − | − |
Solubility DB | 〃 | 〃 | 溶解度の予測。約 4,400件の実験値データベース付属 | 〃 | 126万4千円 | − | − |
LogD Suite | 〃 | 〃 | 部分解離状態の分子の分配係数値(LogD)予測。他にLogP DB、pKa DBが付属。ISISから利用可能 | 〃 | 158万4千円 | − | − |
LogD Sol Suite | 〃 | 〃 | LogD Suiteに溶解度計算機能が付属。他にLogP DB、pKa DB、Solubility DBが付属。ISISから利用可能 | 〃 | 238万4千円 | − | − |
Name | 〃 | 〃 | IUPACルール・CAS Index ルールに基づく分子の命名。また化合物名から構造式を表示する Name to Structure 機能を付属。ISISからも利用可能 | 〃 | 78万4千円 | − | − |
NMR Manager | 〃 | 〃 | NMR実験データ処理、処理データと構造とを組み合わせたデータベースの構築機能。ほとんどのNMRデータ読み込み可能 | 〃 | 78万4千円 | − | − |
MS Manager | 〃 | 〃 | MS 実験データ処理、処理データと構造とを組み合わせたデータベースの構築機能。LC/MS データも読み込み可能 | 〃 | 120万円 | − | − |
Aldrich DB for NMR Manager | 〃 | 〃 | NMRManager Add-onモジュール。AldrichのFT-NMRスペクトルの電子版。構造、スペクトル、沸点など様々な条件で検索 | 〃 | 42万円 | − | − |
Structure Elucidator | 〃 | 〃 | 13Cスペクトルから構造式の推測。CNMR Predictor、NMR Manager等の製品が付随。13CNMRに加え、1HNMR、IR、分子量などの情報を入れると推測精度向上 | 〃 | 792万円 | − | − |
Combi NMR | 〃 | 〃 | コンビナトリアルNMRの結果の自動判定。HNMR、NMRManagerが付随。実測NMRデータバッチ処理結果と予測スペクトルの比較など | 〃 | 398万4千円 | − | − |
Nuts Pro | 〃 | 米AcornNMR | NMRデータ処理。1Dおよび2Dのデータ処理が可能。2D データ処理を高速に行えるアレイドモード・モジュール付属。ほぼ全てのスペクトロメータに対応 | Windows、Macintosh | 19万円 | − | − |
NMRPCPS | 〃 | 米NIH | 高速多次元NMRデータ処理および解析プログラム。ほぼ全てのスペクトロメータに対応 | UNIX、(UNIX)、MacOSX | 300万円 | − | − |
PCA/HSQC | 〃 | 〃 | NMRPieシリーズのモジュールの一つで、、滴定実験などの2D-NMRスペクトルによる評価をサポートし、ドラックデザインなどで効力を発揮するツール | 〃 | 100万円 | − | − |
DYNAMO | 〃 | 〃 | シミュレーティッドアニーリング法を使いNMRデータからマクロ分子や複合体の立体構造の計算が可能 | 〃 | 400万円 | − | − |
TURBO-FRODO | 〃 | 仏AFMB-CNRS | 分子設計支援・分子表示プログラム。多様な分子、X線回折の電子密度マップの読み込み・表示が可能 | SGI、LINUX | 300万円 | − | − |
MRVision | 〃 | 米エム・アール・ビジョン | MRI、CTなどの医療画像解析。DICOM3フォーマットにも対応。Diffusion、Perfusion、Functional MRI、緩和時間の解析等 | SUN、LINUX(RedHat) | 150万円 | − | − |
MEDx | 〃 | 米センサーシステムズ | 医療画像解析。ユーザーフレンドリーなSPM解析環境を提供。3次元化も容易に行え、多様な画像モダリティーで得られる多次元データ画像処理ルーチンにより解析に最適な可視化をもたら医療用画像処理・解析プログラム | SUN、LINUX(RedHat)、(SGI、IBM) | 150万円 | − | − |
Analyze | 〃 | 米MAYO FOUNDATION | 3Dバイオメディカル画像表示/解析。多様な画像モダリティーに対応した、多次元のバイオメディカル画像のインタラクティブな表示・マニピュレーション・測定のための総合プログラム | Windows、UNIX、LINUX | 150万円 | − | − |
EMSE | 〃 | 米Source Signal Imaging | 研究者向けに開発したEEG/MEG Source Estimation、Multimodel Functional Imagingの為のソフトウエアツール | Windows | お問合せ下さい | − | − |
ISIS | 日本MDLインフォメーションシステムズ | 米MDLインフォメーションシズテムズ | 化合物に関する多様な情報を管理、共有および解析する総合的なクライアント/サーバー型情報管理システム。ISIS/Draw、ISIS/Base、ISIS/Hostから構成 | − | − | − | − |
ISIS/Draw | 〃 | 〃 | 化学構造式描画ソフト。ISISの化合物や反応データベースの構築、検索用構造式の作成、ドキュメントや発表資料の作成に使用 | Windows2000/XP | − | − | − |
ISIS/Base | 〃 | 〃 | 小グループでの化合物、反応式ならびに関連データ管理を目的としたデスクトップソフト。ISIS/Hostのクライアントソフトの機能も併せ持つ | 〃 | − | − | − |
ISIS/Host | 〃 | 〃 | ISIS/Baseをフロントエンドとして、サーバー上のさまざまなデータベース(反応式、2D/3D化学構造式、生物活性データなど)にアクセス | Windows2000、SUN Solaris &Oracle | − | − | − |
Relational Chemistry Server Molecule | 〃 | 〃 | Oracle Data Cartridgeテクノロジーを用いた、SQL文による化合物構造式登録および検索可能なオープンアーキテクチャ対応製品 | 〃 | − | − | − |
Relational Chemistry Server Reaction | 〃 | 〃 | Oracle Data Cartridgeテクノロジーを用いた、SQL文による反応式登録および検索可能なオープンアーキテクチャ対応製品 | 〃 | − | − | − |
ISIS for Microsoft Excel | 〃 | 〃 | ISISの構造式検索機能およびインテグレーション機能を、優れたインターフェース、解析機能とプログラム機能を持つ汎用ソフトEXCEL上で実現 | Windows2000/XP | − | − | − |
ISIS/ADK Pro | 〃 | 〃 | ISISカスタマイズ用一連のツール | 〃 | − | − | − |
MDL Report Manager | 〃 | 〃 | Assay ExplorerのアッセイデータやISISの化合物データ及び遺伝子発現データ等のオラクルDBにまたがる検索ができ、 構造活性相関(SAR)レポートが作成可能。Excel,Word、HTLM 及びPDFフォーマットをサポート | 〃 | − | − | − |
Chemistry Rules Interface | 〃 | 〃 | 構造式からディスクリプターを得たり、構造式や反応式をビジネス・ルールに基づき修正するプログラムツール | Windows2000/XP、SUN Solaris | − | − | − |
Chemscape | 〃 | 〃 | WebブラウザーからISIS/Hostを利用するための製品群。Chime、ChimePro、Chemscape Serverから構成される | Windows2000& SUN Solaris&Oracle | − | − | − |
Chime/ChimePro | 〃 | 〃 | Netscape Navigator、Internet Explorerなどブラウザーに構造式を表示するためのプラグイン。 Chime ProはISIS/Hostの構造式検索、スペクトル表示、SCULPTへのリンクなどの機能を持つ | Windows2000/XP、Macintosh | − | − | − |
Chemscape Server | 〃 | 〃 | iPlanetあるいはIISとISIS/Hostとへのリンクを通して、ブラウザーから構造式(2D、3D)および反応検索を行なう | Windows2000、SUN Solaris | − | − | − |
Central Library | 〃 | 〃 | 化合物ライブラリー情報を管理するためのクライアント/サーバー型システム | ISIS/Hostと同環境 | − | − | − |
Afferent | 〃 | 〃 | コンビナトリアルライブラリー合成の計画、プロトコル、解析など一連の作業を支援する。自動合成機器、分析機器と連動するモジュールもある。 スタンドアロン版とネットワーク版がある | クライアント:Windows2000、サーバー:Windows 2000&Oracle | − | − | − |
Reagent Selector | 〃 | 〃 | コンビナトリアルケミストリーにおける試薬を、官能基や種々の物性値、価格などさまざまな基準を基に選択する | クライアント:Windows2000、サーバー:ISIS/Hostと同環境 | − | − | − |
Elan | 〃 | 〃 | 化学者のための電子ノート | クライアント:WindowsNT/2000/XP (Macintosh)、サーバー:WindowsNT/2000/XP&Oracleなど | − | − | − |
Lit Link | 〃 | 〃 | ファクト情報から電子的テキスト情報にアクセスするための一連のアプリケーション。 ElsevierのScience Directなど電子雑誌の全文検索DBにアクセスするLitLink/Standard Serverとイントラットにも応用できるLitLink/Pro Serverがある | クライアント:Windows2000/XP (Macintosh)、サーバー:SUN Solaris、Windows2000&Oracleなど | − | − | − |
Assay Explorer | 〃 | 〃 | アッセイのプロトコル作成、データ入力・管理、結果解析を行いオラクルDB化する統合ソフト。自由度が高く、HTSからマニュアルアッセイ、 探索薬物動態までサポート | クライアント:Windows2000/XP、サーバー:Window2000&Oracle | − | − | − |
Apex | 〃 | 〃 | サンプル管理・プレート管理システム。96、384および1536穴プレートのすべてのプレートフォーマットやミックスプレートにも対応、Assay Explorerとのリンクにより、アッセイ結果からチェリーピックプレートの作成が可能。HTSロボット対応。 | クライアント:Windows2000、サーバー:Window2000&Oracle | − | − | − |
Assay Explorer Report manger | 〃 | 〃 | Assay ExplorerのアッセイデータやISISの化合物データ及び遺伝子発現データ等のオラクルDBにまたがる検索ができ、 構造活性相関(SAR)レポートが作成可能。Excel,Word、HTLM 及びPDFフォーマットをサポート | クライアント:Windows2000/XP | − | − | − |
Pipeline Pilot | 〃 | 米SciTegic | 多機能のコンポーネントをビジュアルに組み合わせることにより、様々な化合物ファイルやデータベースの加工、選択、結合、解析等を行う | クライアント:Windows2000/XP、サ-バー:Windows2000 | − | − | − |
Partek | 〃 | 米パーテック | QSAR、遺伝子など多方面の科学データについて、可視化機能を併せ持つ統計解析ソフト | クライアント:Windows2000/XP、サーバー:SUN | − | − | − |
Sculpt | 〃 | 米MDLインフォメーションシズテムズ | 3次元構造作成ならびにその可視化ソフト。ISISあるいはChemscapeとリンクするほか、発表資料やレポートに最適 | Windows2000 | − | − | − |
DiscoveryGate | 〃 | 〃 | 電子雑誌からファクトデータベース、電子叢書まで、化合物に関する総合的な情報がシームレスに得られるインターネット上 | Windows2000/XP | − | − | − |
Integrated Major Reference Works | 〃 | 〃 | 有機化学の電子化された概説書とMDL 反応データベースとのリンクにより 有機化学の包括的な知識を提供。InfoChemとElsevier, Wiley, Springer, Thiemeなど4出版社ならびにMDLとの協力 | クライアント:Windows2000/XP、サーバー:SUN、Windows2000 | − | − | − |
CrossFire Beilstein | 〃 | 〃 | 有機化合物の最も大きなファクトデータベースの一つで、858万化合物に対する精選された889万反応、3500万物性データを収録した信頼高いデータベース | クライアント:Windows2000/XP、Mac(PowerPC) 、サーバー:AIX4以上、Windows2000 | − | − | − |
CrossFire Gmelin | 〃 | 〃 | 無機化合物(合金、セラミックス、酸化物等)・有機金属化合物の特性・構造・合成法を収録したファクトデータベース(176万化合物、141万反応) | 〃 | − | − | − |
Cheminform RXL | 〃 | 〃 | FIZ Chemie社(独)の反応情報誌ChemiInformから採録される総合的反応データベース。1946年以降の文献から98 万 反応を収録 | ISIS/Hostと同環境 | − | − | − |
Reference Library | 〃 | 〃 | TheilheimerやCOREなど1991年以前に個々に収録された5つのデータベースを一つに統合した反応データベース。 21万反応 | 〃 | − | − | − |
SPORE | 〃 | 〃 | コンビナトリアルケミストリーで注目の低分子固相合成反応データベース。反応に加えてポリマーやリンカーなど最適反応条件情報が得られる。18,000反応 | 〃 | − | − | − |
DerwentJSM | 〃 | 〃 | DerwentのJournal of Synthetic Methods(1980年〜)の電子版。 75,000反応 | 〃 | − | − | − |
ORGSYN | 〃 | 〃 | Wiley&SonsのOrganic Synthesesの電子版(1921年〜)。 汎用的な反応(5,600)を中心に収録 | 〃 | − | − | − |
Metabolite | 〃 | 〃 | 代謝物構造式や代謝経路、スキームなどの薬物代謝情報データベース。62,000の代謝反応情報を網羅。Toxicityとリンク | 〃 | − | − | − |
Toxicity | 〃 | 〃 | 医薬、農薬など化学物質の毒性データベース。RTECSをもとに157,000件。 創薬初期での毒性、代謝研究を支援。 Metaboliteとリンク | 〃 | − | − | − |
CMC | 〃 | 〃 | Pergamon Press社のComprehensive Medicinal Chemistryを元に収録した医薬治験薬化合物データベース、8500化合物 | 〃 | − | − | − |
MDDR | 〃 | 〃 | 医薬開発情報誌Prous社 Drug Data Reportを元に、約133,000以上の開発医薬品情報を収録。 2D/3D構造式検索可 | 〃 | − | − | − |
ACD | 〃 | 〃 | 600社(国内31社)を超える化合物カタログから収録される約228,000化合物に関する2D/3D構造式、サプライヤー並びに価格などの情報を持つ | 〃 | − | − | − |
SCD | 〃 | 〃 | スクリーニング用化合物サプライヤーのカタログ情報を集録。220万化合物 | 〃 | − | − | − |
BLABS | 三井情報開発 | 三井情報開発 | バイオサイエンスにおける研究、解析は以前に比べ様々な分野で大規模に行われており、そのようなプロジェクトでは効率的に試料を管理し、情報を共有するシステムが必要になる。BLABSはバーコードを用いた検体の管理から、情報の管理まで行うシステム(LIMS)である | Windows2000、Redhat Linux Advanced Server、Solaris8 | 400万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2000年下半期 | 国内10サイト |
SCTS21 | 〃 | 〃 | 匿名化システムSCTS21は、平成13年に施行された三省合同の倫理指針である「ヒトゲノム・遺伝子解析研究に関する倫理指針」に準拠しており、個人情報の登録、検体の匿名化から研究側への匿名化された個人情報の受渡しまでといった、匿名化業務をサポートするパッケージソフトである | Windows2000 | 300万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2001年上半期 | 国内20サイト |
GenomicProfiler | 〃 | 〃 | 大量に得られる遺伝子発現プロファイルデータをデータベースで管理するパッケージ。WebインターフェースによりPCA、クラスタリング等による各種解析手法、公共データベースからの自動アノテーション収集機能を搭載した。DNAマイクロアレイ・GeneChipの両方に対応している | Windows2000、Redhat Linux Advanced Server、Solaris8 | 550万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2002年上半期 | 国内5サイト |
RoboSNP | 〃 | 〃 | 主要遺伝子及びSNPデータベースから関連情報を収集、管理し、着目遺伝子に関する情報を効率よく調べる事が可能なシステム。ゲノム、遺伝子、SNPのマップをグラフィカルに参照したり、PCR増幅用のプライマーを作成することが可能である | Solaris8 | 500万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2002年上半期 | − |
VoyaGene | 〃 | 〃 | 遺伝子発現プロファイルデータをデータベースで管理し、データ解析をするとともに遺伝子間の相互作用をシステム同定手法により明らかにするシステム。更に、結果を実験にフィードバックし、システム同定と実験とをインタラクティブに進める研究支援ツール | サーバ:Solaris8、Redhat Linux、クライアント:Redhat Linux、Windows2000/XP | 550万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2003年上半期 | − |
GenomeGambler | 〃 | 〃 | GenoeGamblerは微生物ゲノム配列解析に必要な各種解析プログラム、PhredPhrap, GeneHacker, CRITICA, Glimmer, BLAST等を自動実行し、WEBインターフェースから結果を参照、編集でき、シーケンスデータの取り込みから配列決定、アノテーションまでをカバーする | Redhat Linux、Tru64 Unix、Solaris8 | 150万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2001年上半期 | 国内20サイト |
波平 | 〃 | 〃 | シーケンサから出力された波形データから高精度にSNP候補領域を同定する解析ツール。SNPの検出には独自手法を用いている。一般的によく使用されているPolyPhredの問題(擬陽性が多い、塩基の挿入と欠失にうまく対応できていない)を改良している | Solaris8、Windows2000/XP | 150万円〜、非営利機関価格別途お問合せ | 2003年上半期 | − |
XanaGenome | 〃 | ザナジェン | 最新の微生物ゲノム情報を網羅(2003年初頭で100以上)し、ゲノム、遺伝子情報の閲覧と検索、比較ゲノム解析を容易に行う事ができるデータベース。ユーザー独自の配列を解析して組み込むサービスも別途提供 | − | − | − | − |
GCG Wisconsin Package | 〃 | 米アクセルリス | 約140のコマンド群から成る配列解析パッケージソフトウェアである。約20年の歴史を持ち、世界中の研究者に愛用され続け、高い信頼性を誇っている。ウェブインターフェースSeqWebを使用することで、UNIXユーザでなくても簡単に解析を行ったり、プロジェクト単位でのデータ管理も可能である | Compaq Tru64 UNIX、SGI IRIX、Sun Solaris、Red Hat Linux | 300万円(初年度使用料)、99万円(次年度以降)、アカデミックプライス別途問い合わせ | 2001年3月 | 国内50サイト |
SeqWeb | 〃 | 〃 | GCG Wisconsin PackageのWebインターフェース | Compaq Tru64 UNIX、SGI IRIX、Sun Solaris、Netscape4.77-4.78、Internet Explorer5.0以上(MacintoshはInternet Explorer4.5) | 100万円〜、アカデミックプライス別途問い合わせ | 2001年7月 | 国内26サイト |
SeqMerge | 〃 | 〃 | 高速かつ強力なアセンブル機能とGUIを備えたDNAフラグメントアセンブルツール | 〃 | 176万4千円〜、アカデミックプライス別途問い合わせ | 2000年6月 | − |
GRAIL Pro | 〃 | 〃 | GCG Wisconsin Packageで使用可能なゲノム配列のコード領域予測ツール | 〃 | 176万4千円〜、アカデミックプライス別途問い合わせ | 2000年3月 | − |
DS SeqStore | 〃 | 〃 | DBMSとしてOracleを使用し、膨大に増加を続ける配列及びその解析データを公共データ、プライベートデータ共に管理するデータマイニングのためのパッケージツールである | ”Compaq Tru64 UNIX、SGI IRIX、Sun Solaris” ”Netscape4.0以上、Internet Explorer4.0以上” ”Oracle8.0x” | 別途問い合わせ | 2001年1月 | − |
DS Gene | 〃 | 〃 | アクセルリス社が提案する創薬プラットフォームDiscovery Studioシリーズで核酸及びアミノ酸配列解析を担うWindows用デスクトップ配列解析ソフトウェアである。その使いやすさ、表示の美しさには定評がある | Windows2000/XP | 80万円〜非営利機関価格別途お問い合わせ | 2002年上半期 | − |
MacVector | 〃 | 〃 | Macintosh用配列解析ソフトウェアとして、今なお世界中の研究者に愛用されつづけている。十分な機能と誰にでもわかりやすい操作性に定評があり、Discovery Studio Geneの元になった | MacOS | 80万円〜非営利機関価格別途お問い合わせ | − | − |
DS GeneAtlas | 〃 | 〃 | DS GeneAtlasは従来法(PSI-BLAST,HMMs等)に加えて、二次構造評価(SeqFold)および三次立体構造自動構築(HTM:High Throughput Modeling)による生化学機能予測を行なうことにより、機能予測の難しい遺伝子に対しても独自の高信頼性アノテーションを付加する解析システムである | Solaris8、Linux、IRIX | 別途お問い合わせ | 2003年上半期 | − |
DS AtlasStore | 〃 | 〃 | DS AtlasStoreは33生物種の公知ゲノムに対して70%〜99%の遺伝子について、配列/構造/機能などの高品質アノテーション(370万アラインメント,170万3D構造)を提供し、機能の情報、3D構造情報、活性部位情報及びSCOPファミリ情報等により検索可能なプロテオミクスデータ管理システムである | サーバ:Solaris8、Redhat Linux、WindowsNT/2000、IRIXクライアント:Windows98、NT、2000、XP | 別途お問い合わせ | 2003年上半期 | − |
SOSui | 〃 | 名古屋大学美宅研究室 | 膜タンパク質判別および膜貫通へリックス予測システム。Kyte-Doolittleの疎水性指標と、新規に定義した両親媒性および非電荷指標などを用いて、従来の手法と比べて高速かつ高精度な予測を実現している。他にシグナルペプチドやダンベル型タンパク質の判別プログラムもある | Sun Solaris | 50万円、アカデミックプライス別途問い合わせ | 99年11月 | 国内13サイト |
TRANSFAC | 〃 | 独バイオベース | 真核生物の転写因子およびその結合部位に関するデータベース。分子生物学者のグループにより校閲されているため高い信頼性を持つ。データベースに含まれる位置特異的重み行列を用いた転写因子結合部位予測ツールMATCHなどが含まれる。目的別にオプションデータベースが用意されている | Compaq Tru64 UNIX、SGI IRIX、Sun Solaris、HP-UX | 年間使用料416万7千円〜、アカデミックプライス別途問い合わせ | 99年7月 | 国内7サイト |
TRANSCOMPEL | 〃 | 〃 | Composite element(複合シスエレメント)に関するデータベース | 〃 | 年間使用料104万2千円〜 | 〃 | 国内1サイト |
TRANSPATH | 〃 | 〃 | 転写因子のトランス活性化制御機構に関するデータベース。手書きのグラフィカルマップや、検索条件によって動的に生成されるネットワーク表示などにより、複雑な制御機構をわかりやすく表示できる。分子生物学者のグループにより校閲されているため高い信頼性を持つ | 〃 | 年間使用料666万7千円〜 | 2001年上半期 | − |
TRANSPLORER | 〃 | 〃 | 遺伝子制御領域の解析を行うためのデスクトップツール。脊椎動物の遺伝子に関する転写開始部位や哺乳類の遺伝子の最初のエクソンの予測、ならびに転写因子結合部位の同定のためのツールを備える。簡単に使える操作性とわかりやすい画像表示により、PC上で手軽に利用できる | WindowsNT/2000/XP、Linux | 30万円〜非営利機関価格別途お問い合わせ | 2003年上半期 | − |
LabOnWeb | 〃 | イスラエル・コンピュージェン | インターネット経由で利用できる、最新の配列解析サービスです。InstantRACE(Rapid amplification of cDNA ends)によるESTの伸長、相同性検索、遺伝子発現解析、機能解析等を網羅的に兼ね備えている | Webブラウザ(IE5.0以降、Netscape4.04以降)を搭載したインターネットにアクセスできるコンピュータ | 〃 | 2000年8月 | 国内1サイト |
Gencarta | 〃 | 〃 | Alternative Splicingを重視したゲノム・トランスクリプトーム・プロテオームデータベース。in silicoによる遺伝子・転写産物・タンパク質の予測結果と、既存のデータベースからの情報やGene Ontology、Tissue Distributionなど多岐にわたるアノテーションを備えている | サーバ側:Sun Solraisが稼動するサーバ、Firewall用PC、Oracle8i。クライアント側:Webブラウザ(IE5.0以降、Netscape4.04以降) | 〃 | 2001年7月 | 国内1サイト |
Z3 | 〃 | 〃 | 2次元電気泳動によって得られるゲルイメージを解析するソフトウェア。パラメータ設定なしでも使い始められるユーザインタフェースと、高速かつ高精度の解析性能を備える。複数のイメージを統合して仮想的に一つのイメージにまとめるRaw Master Gelなどユニークな機能を持つ | WindowsNT/2000/XP | 別途お問い合わせ | − | − |
Phred/Phrap | 〃 | 米コドンコード | 最も標準的に使用されているゲノム配列アセンブルソフトウェアのパッケージ。Phredは精度の高いベースコール結果を配列の品質情報と共に出力する。PhrapはPhredのクオリティ情報を加味し、精度の高いアセンブルを実現する | WindowsMe/2000/XP、Linux、MacOS、Tru64 UNIX、Solaris8 | 〃 | − | − |
EXPOD | − | 三菱総合研究所 | 線状ホモポリマーのデータベースと基本特性の予測を通じ、新規高分子材料の開発を支援するエキスパートシステム。パラメータ最適化機能、候補ポリマー探索機能を拡張。93年から海外進出 | SUN | 問い合わせ | 90年9月 | 昭和電工、住友化学、東レ、三菱化学、クライアント等55セット |
PALSAR | − | 〃 | データベース、混合則ツールなどの基本ツール群と数値計算、シミュレーションなどの解析ツール群が統合されたポリマーアロイ設計支援システム | 〃 | 〃 | 94年4月 | アドバイザー会社、クライアント等13セット |
NanoBox(ナノボックス) | ナノシミュレーション | ナノシミュレーション | 液晶、合成高分子のシミュレーションで実績のある分子材料設計用分子動力学ソフトウエア。使用メモリー少なく、大規模計算が容易。液晶では世界最高峰のソフト | Pentium4&Alpha Linux機、SGI 他 Unix機 | 120万円(大学60万円)。力場、オプション機能別売 | 98年4月 | 19本 |
MolStudio | NEC | NEC | 分子軌道計算プログラムGaussian98のプリポストシステム。PC上で動作し、入力データの作成や計算結果の表示が可能。UNIXサーバー上のGaussianやWindows版Gaussian98の計算実行制御等も可能 | Windows98、98SE、Me、XP、2000Pro、NT4.0WS | 9万8千円、8万円(アカデミック) | 2002年7月 | − |
SemanticObjects | NECソフト | NECソフト | 新製品のバイオ情報統合プラットホーム。複数のデータベースを統合的に扱えるだけでなく、その中からルールを抽出して知識を取り出し、その知識を統合していくこともできる。また、BLASTなどの解析ツールを組み込むためのインターフェース機能も備えている | Windows、Linux | 詳細問合せ | 2003年4月 | − |
Finch-Suite | 理経 | 米ジオスパイザ | ゲノム情報管理のためのLIMS。生物学的情報を専門的に徹底的に管理できる。Phrap/Phred,Consed,Cross_Match,Swatなどのアルゴリズムも提供 | − | − | 2000年 | − |
PatternHunter | 〃 | 米バイオインフォマティクスソリューションズ | PC上で動作する高速な相同性検索ソフトウェア | Windows | − | − | − |
PEAKS | 〃 | 〃 | ペプチドのMS/MS実験データからアミノ酸シークエンスを同定する先進的なソフトウエアシステム | 〃 | − | − | − |
PROSPECT | 〃 | 〃 | スレッド手法に基づくタンパク質の構造予測用ソフトウエア | 〃 | − | − | − |
Sentient Platform | 〃 | 米バイオセンティエンツ | IMOデータストラクチャをサポートするインテリジェントなアプリケーションのためのフレーム、IOHにより統一されたビュー、分析、レポートおよび検索のGUI、1つの統合された、仮想データベースである、IOPを提供する | Windows95、98、2000、NT、XP | − | − | − |
GeneTraffic | 〃 | 米IOBIONインフォマティクス | DNAマイクロアレイに最良のマイクロアレイ解析システム | インテルマシン | − | − | − |
MOE | 菱化システム | 加ケミカルコンピューティンググループ | ソフトウエアの開発環境と実行環境を一体化させた統合計算化学システム。 ドラッグデザイン、コンビケム、蛋白質モデリングの機能を搭載 | SGI、SUN、HP、IBN、Windows、Intel-Linux | − | 1997年9月 | − |
ADF | 〃 | 蘭サイエンティフィックコンピューティングモデリング | 密度汎関数法分子軌道計算プログラム | SGI、IBM、SUN、HP、COMPAQ、Intel-Linux | − | 1998年11月 | − |
COSMOtherm | 〃 | 独コスモロジック | 第一原理計算による熱力学物性推算プログラム | SGI、Intel-Linux、Windows | − | 2001年9月 | − |
COSMO UI | 〃 | 菱化システム | COSMOthermユーザーインターフェース | Windows | − | 2003年6月 | |
Turbomole | 〃 | 〃 | Ab initio法分子軌道計算プログラム 高速な密度汎関数法およびCOSMO法計算機能 | SGI、COMPAQ、HP、IBM、Intel-Linux | − | 2001年9月 | − |
MedeA | 〃 | 米マテリアルズデザイン | Material Informatics/Quantum統合型材料設計支援システム | Windows | − | 1999年1月 | − |
Gaussian 03 | 〃 | 米ガウシアン | Ab initio法分子軌道計算プログラム | SGI、COMPAQ、HP、SUN、IBM、Intel-Linux、Windows、Mac | − | 1998年10月 | − |
GaussView | 〃 | 〃 | Gaussian98のグラフィカルユーザインターフェース | 〃 | − | 1998年10月 | − |
Direct Force Field | 〃 | 米イーオンテクノロジー | 力場パラメータ開発プログラム | Windows | − | 2001年12月 | − |
CBIS | 〃 | 米ケムイノベーション | 化合物情報、アッセイ情報、レポート等、化学・薬学・生物学研究におけるデータや情報を一括管理する統合情報管理システム | 〃 | − | 2002年8月 | |
KDE | 〃 | 英インフォーセンス | ワークフロー管理とリソースの統合を特徴とするデータマイニングシステム | 〃 | − | 2002年8月 | − |
Colors | 〃 | 東北大学宮本研究室 | 高速化量子分子動力学計算プログラム | SGI、Intel-Linux | − | 2002年1月 | − |
MOPAC2002、WinMOPAC | 〃 | 富士通 | 高分子向けにDistanceCutoff法を用いた局在化分子軌道計算プログラム、Windows版MOPAC | Unix、Linux、Windows | − | 1999年4月 | − |
Carbon Analyzer | 〃 | 藤本宏之&惠子 | 人造黒鉛の格子定数および結晶子の大きさ測定プログラム | Windows | − | 2002年5月 | − |
SYBYL/Base | 住商エレクトロニクス | 米トライポス | SYBYL基本モジュールでグラフィックス、分子動力学、エネルギー計算、QCPEとのインターフェース、モレキュラースプレッドシートが含まれる | IRIX、HP-UX、Linux | お問い合わせください | 1988年5月 | − |
QSAR | 〃 | 〃 | 構造活性相関、3次元構造活性相関CoMFA、クラスター解析 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Advanced CoMFA | 〃 | 〃 | CoMFAのパワーアップモジュール | 〃 | 〃 | 〃 | − |
HQSAR | 〃 | 〃 | ホログラムフィンガープリントを用いて、大量の化合物に対して構造活性相関を行う | 〃 | 〃 | 1997年8月 | − |
Leapfrog | 〃 | 〃 | de nove design リガンドの候補構造自動発生 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
DISCO tech | 〃 | 〃 | ファーマコフォア探索プログラム | 〃 | 〃 | 2001年12月 | − |
Advanced Computation | 〃 | 〃 | 立体配座解析、ディスタンスマッピング、レセプターマッピング | 〃 | 〃 | 1988年5月 | − |
Recepter | 〃 | 〃 | 高速アクティブアナログアプローチ | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Biopolymer | 〃 | 〃 | 生体高分子構築、アミノ酸辞書。ループサーチGenetic Algorithmを用いてリガンド及び相手のたん白質の側鎖をすべてまたは部分的に動かしてFlexible Ligand Dockingを高速に行う | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Composer | 〃 | 〃 | ホモロジーモデリング | 〃 | 〃 | 〃 | − |
MatchMaker | 〃 | 〃 | InverseFoldingの手法によりたん白質の構造を構築する | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Protable | 〃 | 〃 | 各残基毎に立体構造の妥当性を評価 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
CONCORD | 〃 | 〃 | 2次元構造をを高速に3次元化する | 〃 | 〃 | 〃 | − |
MM2 / MM3 | 〃 | 〃 | アリンジャー教授の経験的力場法プログラム | 〃 | 〃 | 〃 | − |
MOLCAD | 〃 | 〃 | 3次元分子特性可視化プログラム | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Legion | 〃 | 〃 | 電子的なコンビナトリアルライブラリー作成プログラム | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Selector | 〃 | 〃 | ダイバーシティー評価・フィルタリング用プログラム(記述子の相対距離評価法) | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Diverse Solutions | 〃 | 〃 | ダイバーシティー評価・フィルタリング用プログラム(記述子の絶対配置評価法) | 〃 | 〃 | 〃 | − |
UNITY | 〃 | 〃 | 分子データベース検索システム。2次元、3次元での検索以外に、分子の柔軟性を考慮した3次元フレキシブルサーチが行える | 〃 | 〃 | 〃 | − |
FlexX | 〃 | 〃 | リガンド分子/レセプターのドッキング。リガンド分子とたん白質との相対配置を高速計算 | 〃 | 〃 | 1998年12月 | − |
GeneFold | 〃 | 〃 | 立体構造未知のたん白質のFoldingPatternを高速計算。HomologyModelingの手法と組み合わせて3次元構造を決定 | 〃 | 〃 | 2001年12月 | − |
Chem Enlighten | 〃 | 〃 | イントラネットを利用する簡易データベース。クライアントはブラウザーのみで動作可能。大量のデータに対しスプレッドシート形式でソート、フィルターが可能。またMolecular DiversityでのSubsetセレクションが可能 | 〃 | 〃 | 2000年4月 | − |
C Score | 〃 | 〃 | たん白質/リガンド複合体の結合エネルギーを3つのスコアで計算( G-Score、D-Score、PMF-Score) | 〃 | 〃 | 1999年12月 | − |
SITE ID | 〃 | 〃 | たん白質構造の活性ポケットを探索 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Distill | 〃 | 〃 | 分子の共通骨格を基にクラスター化、構造上の特徴を可視化しながら解析を進めることが可能 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
FlexS | 〃 | 〃 | 分子重ね合わせプログラム。対象分子を一度フラグメントに分解して結合情報を元に再構築。多量の分子を高速に重ねあわせが可能 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Confort | 〃 | 〃 | ダイバーシティの高い安定コンフォメーションを高速に発生 | 〃 | 〃 | 2000年12月 | − |
VolSurf | 〃 | 〃 | ADME関連予測QSARツール | 〃 | 〃 | 2001年12月 | − |
CombiFlexX | 〃 | 〃 | コンビナトリアルライブラリー専用ドッキングツール | 〃 | 〃 | 2001年12月 | − |
OptDesign | 〃 | 〃 | Dissimilarity による試薬選択、Product, ReagentのMW, ClogP, etcによるFiltering、価格などルーレット法によるBiased Selection,各種機能により最適な反応Matrixの提案を行う | 〃 | 〃 | 2002年12月 | − |
RACHEL | 〃 | 〃 | structure-based lead optimization Toolで、タンパク質の活性サイトの情報から、SBDDでコンビナトリアル構造を自動で最適化させるモジュール | 〃 | 〃 | 2003年4月 | − |
hint! | 〃 | 〃 | logPや各種パラメータ(Hint Score)計算や分子間相互作用フィールドの計算と表示を行います。3D-QSARの記述子としてもお使いいただける | 〃 | 〃 | 〃 | − |
Molconn-Z | 〃 | 〃 | 各種分子パラメータ計算モジュールです。数百種の記述子を計算可能各原子の電子的な状態を反映するE-State値の計算が可能です。また、計算される記述子を用いてOptiSimTM法による『Diversityを考慮した分子選択』にも利用することができる | 〃 | 〃 | 〃 | − |
ZAP | 〃 | 〃 | 分子の electrostatic potential を計算するソフトウェアパッケージです。ZAPではelectrostatic potentialを用いた各種パラメータや、3D QSAR fieldsを計算することが可能 | 〃 | 〃 | 〃 | − |
FlexPharm | 〃 | 〃 | Phamacophore定義を利用したDockingでFlexXの拡張 Program。Post Processを不要に | 〃 | 〃 | 2003年7月 | − |
FUGUE | 〃 | 〃 | HOMSTRADデータベースを使用したタンパク質の構築のための新しいホモログ認識・アラインメントtool | 〃 | 〃 | 2003年7月 | − |
FlexE | 〃 | 〃 | タンパク質のRotamerを予め準備することでタンパク質のFlexibityを考慮するDocking program | 〃 | 〃 | 2003年11月 | − |
Desk Top プロダクト | |||||||
SARNavigator/Base | 〃 | 米トライポス | HTSデータ解析のためのケミカルスプレッドシート | PC | お問い合わせください | 2003年7月 | − |
SARNavigator/HTS | 〃 | 〃 | HTSデータ解析のためのケミカルスプレッドシート | 〃 | 〃 | 〃 | − |
SARNavigator/HQSAR | 〃 | 〃 | HTSデータ解析のためのケミカルスプレッドシート | 〃 | 〃 | 〃 | − |
LeadScope | 〃 | 米リードスコープ | 化合物ライブラリ解析・視覚化・マイニングツール | 〃 | 170万円〜 | 2000年10月 | − |
Alchemy2000 | 〃 | 米トライポス | 分子動力学、配座解析、たん白質構築構造計算:MM3、MOPAC6.0、PM3物性計算:双極子モーメント、エネルギー、体積、表面積、分子量、HOMO/LUMOその他:WEBブラザーのhelperアプリケーションでの利用可能、Networkでの利用可能 | 〃 | 19万8千円 | 1996年10月 | − |
Nugenesis SDMS | 〃 | 米ヌージェネシス | 実験データ、研究レポート総合管理システム。FDA 21CFR Part11に準拠。 | 〃 | お問い合わせください | − | − |
Innaphase WatsonLIMS | 〃 | 米インナフェーズ | ADMEに特化したLIMS | 〃 | 〃 | − | − |
Gaussian 03 | 〃 | 米ガウシアン | Ab initionの構造最適化ソルバGaussianの最新バージョン、蛋白質等にも適用可能に | UNIX, Linux | 〃 | − | − |
Gauss View | 〃 | 〃 | Gaussianプリ・ポストシステム(WSデスクトップ)Gaussian計算の入力データ作成、出力可視化、解析を行う | " | 〃 | − | − |
MolStudio | 〃 | NEC | Gaussianプリ・ポストシステム(PCデスクトップ)リモート計算サーバーに接続してデスクトップクライアントからGaussian計算の入力データ作成、出力可視化、解析を行う | PC | 〃 | − | − |
CrystalMaker 簡易日本語マニュアル付き | 〃 | 英クリスタルメーカー | 写真並みのカラー画像で結晶構造を生成、表示、操作するプログラム。マルチウインドウ・マルチビュー・マルチアンドゥといった使いやすさに加え、高速な描画性能、かつ20,000原子に対応。結晶サイト毎に3要素までの断片的占有情報を持たせ、同梱の無償モジュールCrystalDiffractでの回折パターン計算に使用可。様々な原子、結合および多面体のスタイルをカラー、グレースケール、白黒で、写真級にリアルにあるいは素朴なタッチでプロット可能 | Mac、PowerMac | 11万9千円/アカデミック8万6千円 | − | − |
CrystalMaker 簡易日本語マニュアル付き + CrystalDiffract Pro | 〃 | 〃 | 写真並みのカラー画像で結晶構造を生成、表示、操作するプログラム。CrystalDiffractProを使えば、制作したファイルから、エックス線および中性子粉末回折パターンを直接生成できる。格子欠陥もモデル化し、複雑な空間配置の分子さえ容易に理解できる環境を提供する | 〃 | 15万9千円/アカデミック11万4千円 | − | − |
CrystalDesigner | 〃 | 諾クリスタル・ストラクチャー・デザイン | Macintosh上にであらゆる結晶構造を構築、検討、視覚化するための統合型ツール。結晶構造データをCIFファイルからインポートすることができる。データ入力も容易。230の空間群のすべてと、700を超える多様な原子、共有原子価、およびイオンの半径がプログラムに組み入れられている | 〃 | 8万4千円/アカデミック5万7千円 | − | − |
Crystal Kit | 〃 | 米トータルレゾリューション | CrystalKitはMacTempasを補助するプログラムで、特に、欠損のある結晶構造を作成するときに有効。最終的な構造体は1つの単位セルとして定義し、ストラクチャーファイルとして書き出しその画像構成をMacTempasで解析する。PICT、PAINT、EPSの形式で保存できる。MacTempasで作成した結晶構造のデータを読込んでモデル作成を行うことも可能 | 〃 | 39万6千円 | − | − |
DIAMOND | 〃 | 独クリスタルインパクト | 可視的な結晶構造情報システムとして機能し、結晶構造データに関する日常的な作業、主に結晶構造データの可視化を可能にする多数の機能を統合する。大量のデータ処理、分子の生成から複雑な無機構造フレームワークの構築にわたる幅広い機能を備えるDIAMONDは、界面および材料科学者だけでなく、分子および固体化学者のための唯一のツール | Win95/98/Me、WinNT/2000 | 19万円/アカデミック10万5千円 | − | − |
WAFERMAP Professional Version | 〃 | 独ボーイン | クリーン・ルーム外での計測データの分析・編集作業がパソコンベースで可能。半導体ウエハ上の正確な物理パラメータを収集・編集し、分析して可視化するためのパッケージ・ソフト。エリプソメータ、膜厚計および4点プローブのような様々な計測ツールからデータ・ファイルを読込可。読込後、ラインスキャン、等高線図、2D、3Dプロット、又はヒストグラム等の可視化・印刷、またデータの複雑な演算操作も可能。基本仕様として、手動計測機器でのマップ生成や、異なる自動計測機器間(同fab内で別機種の4点プローブ等)の統合的な可視化が可能 | Win95/98、WinNT/2000 | 31万9千円 | − | − |
HPLC Column Manager | 〃 | 英リマソン | LCカラムインベントリー作成、カラム予約、カラムの利用j状況を表示、過去の移動相を把握・損傷、誤用防止の警告リストを作成、カラムテスト方法とパフォーマンス・リミットを保存、パフォーマンスのグラフ化、カラムとともに使用される溶出液と分析物の量を記録、カラム履歴の監査証跡を作成 | Win95、WinNT | 32万2千円 | − | − |
CLIP - Computed Lipophilicity Properties/Full Package | 〃 | 瑞ローザンヌ大 | ローザンヌ大学医化学研究所で作成、開発され、以下が可能。・"親油性ポテンシャル"(MLP)の計算と提示・MLPからのn-オクタノール/水分配係数(log Poct)の計算・個々の配座に対する仮想log P値の計算と、化合物に接近可能な親油域の探査・分子と高分子周囲の所定域におけるMLPの計算と提示・MLPの計算と比較分子フィールド分析(CoMFA)への組入れが可能 | UNIX | 52万6千円/field only31万9千円/アカデミックは要問合せ | − | − |
HYDROGEOCHEM | 〃 | 米エスエスジー | 飽和−不飽和媒体における、水文学的移送と地球化学的反応の結合モデル。一過性または定常状態のNa、水成成分の移送、一過性または定常状態のNs吸着性成分およびイオン交換サイトの物質収支をシミュレートするように設計されている。HYDROGEOCHEMは、移送経路に沿ってN成分種、Mx複合種、My吸着種の種分配を計算する。Mzイオン交換種、そしてMp潜在的沈殿種 | DOS、UNIX | 28万2千円 | − | − |
MOVER | 〃 | 〃 | 地面の三相(水、油、およびガス)の有限要素モデル。現在のこの種の最も高度なモデル、MOVERを使用して水、油、およびガスのフローのモデルを作成し、飽和/不飽和層準のNAPLエントラップメントを最小限にしてLNAPLと水の回収を最適化する | Win95/98、WinNT/2000 | 33万3千円 | − | − |
MSDS Digital Filing Cabinet Pro | 〃 | 米ケムエスダブル | MSDSのドキュメントの記憶および検索用に特に設計されたドキュメント・イメージング・アプリケーション。イメージとしてページを格納する | Win95、WinNT | 24万円/アカデミック16万5千円 | − | − |
DESIGN-EXPERT for Windows | 〃 | 米スタットイーズ | Windows対応の実験計画(DOE)用ソフトウェアは、・プロセスに影響を及ぼす致命的要因をスクリーニング。・応答曲面法(RSM)のスクリーニング・応答曲面をビジュアル化。12の応答までの最大妥当性を同時に見いだす計算能力最適化機能がすばらしい | Win95/98、WinNT/2000/XP | 18万2千円 | − | − |
GRG2 | 〃 | 米ダブルティーアイ | 制約付非線形最適化プログラム。15年以上にわたり石油、化学、防衛、財政、農業、プロセス制御などの分野でj豊富な実績。LS(Large Sparse)GRG2、ソースコード等はお問い合わせください | Windows、UNIX | 要問合せ | − | − |
PrecisionTree | 〃 | 米パリセード | 既存のスプレッドシートで判断ツリーと影響図の作成を初めて実現。実績ある意思決定解析技術を用いて最良の進路を確認。また、スプレッドシートを意思決定モデルに直接統合。影響図は不確実性を含めた問題の構成要素間の関係の検討に使用。Proは意思決定アナリストに必要とされる最もクリティカルな機能を組み込んで拡張されている | Win95/98、WinNT/2000 | 9万5千円 /Pro 14万7千円 | − | − |
EsTerra Bio Informatics Ware | サイエンス・テクノロジー・システムズ | メディアフュージョン | テラバイト級のネイティブXMLストレージを核に、膨大なBioDataに対応する柔軟で拡張性の高いXMLインターネットシステムを構築するための、サーバ及びクライアントアプリケーション基盤ソフトウェア | Linux/Solaris | 別途お問い合わせください | 2003年8月以降 | − |
Reatop(リートップ) | 〃 | サイエンス・テクノロジー・システムズ | 「研究・試験業務において使用する試薬の統合的な管理を実施したい」という声から生まれた試薬管理システムです。試薬受入・貸出・返却・廃棄・管理履歴・帳票出力の機能をもち、バーコード入力による業務の簡略化、電子天秤からの秤量値自動取り込み、既存H/W利用により低コスト導入を実現。21 CFR Part 11 にも対応可能 | Windows2000/XP | 別途お問い合わせください | 2003年8月末予定 | − |
明日の新薬構造式データ | テクノミック | テクノミック | 化学構造式可読フォーマットによる治験薬データベース | ISIS/Baseなど | 年間38万円から | 93年4月 | − |
明日の新薬CD-ROM | 〃 | 〃 | 国内外の医薬品開発情報を提供する「明日の新薬」CD-ROM版 | Windows95/NT | 年間70.5万円から | 99年1月 | − |
SCREENING ALERT DATABASE | 〃 | 田辺R&Dサービス | 医薬特許から生物活性試験法を中心に新規化合物情報を提供 | ACCESS、PDFファイル | 年間75万円から | 98年 | − |
Patent fast-alert | 〃 | カレント・ドラッグス | 化学構造式可読フォーマットによる医薬品特許速報データベース | ISIS/Baseなど | 年間120万円から | − | − |
Adis R&D Insight | 〃 | エイディス・インターナショナル | 世界治験薬データベース。詳細な薬剤情報と引用文献の評価も収録 | Windows95 | 年間120万円から | 95年1月 | − |
IDdb | 〃 | カレント・ドラッグス | Internet/Intranet対応の医薬品研究開発データベース(薬剤、特許、学会、文献、ニュースを包括的に提供) | Intranet:Oracle 8、RS3、Internet | 年間500万円から | 93年5月 | − |
ACTFUND | 〃 | 武田敬一 | 天然物由来活性物質データベース。UV値による検索、化学構造の表示 | Windows95/NT | 60万円(最終版) | 92年1月 | − |
CrossFire Beistein | ユサコ | 米MDLインフォメーションシステムズ | 1700年代からの有機化合物を約800万件と900万件の反応情報を収録。クライアント/サーバー方式のネットワークで稼働し、独自のインターフェースで構造検索を可能とし、物性データ、固定データ等、全650以上の検索項目を提供。更新頻度は年 4 回 | サーバー:RS6000/WindowsNT、クライアント:Windows/Mac | 詳細問い合わせ | − | − |
CrossFire Gmelin | 〃 | 〃 | 1700年代からの無機化合物、有機金属化合物を約160万件と130万件の反応 情報を収録。クライアント/サーバー方式のネットワークで稼働し、独自のインターフェースで構造検索を可能とし、物性データ、固定データ等、全800以上の 検索項目を提供。更新頻度は、年 4 回 | 〃 | 詳細問い合わせ | − | − |
AutoNom 2000 | 〃 | 〃 | 化学構造を入力することにより、IUPAC名を導き出すソフト。立体構造の命名も可能 | Windows、Mac | 詳細問い合わせ | − | − |
Dictionary of Organic Compounds on CD-ROM | 〃 | 米CRCプレス | 有機化合物約26万件を収録する辞典。テキスト検索・化学構造検索および相互のリンク検索が可能 | Windows | 72万円〜(企業向け)、他アカデミック価格あり | − | − |
Dictionary of Inorganic and Organometallic Compounds on CD-ROM | 〃 | 〃 | 無機、有機金属化合物を合わせて10万1千件を収録する辞典。テキスト検索・化学構造検索および相互のリンク検索が可能 | 〃 | 58万円〜(企業向け)、他アカデミック価格あり | − | − |
Dictionary of Natural Products on CD-ROM | 〃 | 〃 | 天然物質約15万件を収録する天然物辞典。テキスト検索・化学構造検索および相互のリンク検索が可能 | 〃 | 95万円〜(企業向け)、他アカデミック価格あり | − | − |
Dictionary of Drugs on CD-ROM | 〃 | 〃 | 薬物約4万件を収録する辞典。テキスト検索・化学構造検索および相互のリンク検索が可能 | 〃 | 23万円〜 | − | − |
The Combined Chemical Dictionary on CD-ROM | 〃 | 〃 | Dictionary of Organic Compounds、Dictionary of Inorganic and Organometallic Compounds、Dictionary of Natural Products、Dictionary of Drugs、Dictionary of Carbohydrates の 5 辞書中の全エントリー、50万件以上の化合物を収録。テキスト・構造の両方から検索可能。6ヵ月毎に更新 | 〃 | 115万円〜(企業向け)、他アカデミック価格あり | − | − |
CHEMnetBASE (Web Version) | 〃 | 〃 | The Combined Chemical Dictionary, The Handbook of Chemistry & Physics, Polymers-A Property Database をインターネット経由で提供する Web 版の新製品。テキスト・構造検索機能あり。検索結果のテーブル表示、化学構造式へのリンク機能等あり | Windows、Mac | 詳細問い合わせ | − | − |
Dictionary of Commonly Cited Compounds on CD-ROM | 〃 | 〃 | 化学文献に頻出する約2.5万件の化学物質に関するデータベース | 〃 | 23万円〜 | − | − |
Index Chemicus Database for ISIS | 〃 | 米トムソンISI | 新規化合物の速報/索引誌で世界の主要な約110誌の有機化学専門雑誌をカバー。1993年より収録され、部分構造検索ができる | Open VMS or UNIX | 詳細問い合わせ | − | − |
Index Chemicus on CD | 〃 | 〃 | 上記製品のCD-ROM版。抄録を含み、また部分構造検索が可能 | Windows | 詳細問い合わせ | − | − |
Current Chemical Reactions (CCR) | 〃 | 〃 | 世界の有機化学専門誌に発表される新規合成反応の抄録誌で、約350誌の有機化学および製薬学の学術誌より採録 | Open VMS or UNIX | 詳細問い合わせ | − | − |
ISI Chemistry | 〃 | 〃 | 上記製品の Web 版。反応情報のデータ件数 66 万件以上、化合物情報 98 万件以上 | Windows、Mac | 詳細問い合わせ | − | − |
ChemPrep on CD | 〃 | 〃 | Current Chemical Reaction の Subset 版であり、1985 年以降の反応情報を収録しており、更新データ数は年間35,000件 | Windows | 52万円〜 | − | − |
Chemistry Citation Index | 〃 | 〃 | 科学全般の引用文献索引であるSCIの化学編 | Windows、Mac | 詳細問い合わせ | − | − |
Reaction Citation Index | 〃 | 〃 | CCRとSCIを結合し、化学反応の引用文献に導くもの。350誌以上の有機化学、農芸化学、製薬学等の雑誌から重要な化学反応を厳選し、書誌情報および反応条件、立体化学、生物活性等とともに収録 | Open VMS or UNIX | 詳細問い合わせ | − | − |
Current Contents on Diskette / Physical, Chemical & Earth Sciences | 〃 | 〃 | 重要学術雑誌の目次速報誌。著者抄録が付加されているので、いち早く学術誌に掲載される論文の内容を正確に把握可。著者へ直接reprint請求(著社側の好意で送付される)可。毎週発行 | Windows、Mac | 抄録付:20万円〜、抄録なし:12万円〜 | − | − |
Current Contents on CD-ROM / Physical, Chemical & Earth Sciences | 〃 | 〃 | 上記製品のCD-ROM版。毎週発行。常時1年間分検索 | Windows | 42万円〜 | − | − |
Current Contents Connect / Physical, Chemical & Earth Sciences | 〃 | 〃 | 上記製品の Web 版。毎日更新 | Windows、Mac | 58万円〜 | − | − |
Synthline | 〃 | スペイン・プラウスサイエンス | 臨床段階中の反応合成経路データベース。約9,700件以上の合成経路情報とこれらの約49,000件以上の合成中間体データ及び6,000件以上の医薬品データを提供(Jun.2003)。隔月更新。CD-ROM版及び Web 版あり | Windows98/2000/XP | 52万円〜 | − | − |
Ensemble | 〃 | 〃 | 前臨床段階から上市後までの過去の医薬品開発に関わった化合物に付いての開発段階情報、特許、関連文献を収録。毎月更新。DVD-ROM版及び,Web版あり | 〃 | 117万円〜 | − | − |
MFLine | 〃 | 〃 | 実験薬理の情報を文献としてでは無く、発表されたデータを収録しているデータベース。隔月更新。CD-ROM版のみ | 〃 | 66万円〜 | − | − |
DailyDrugNews .com | 〃 | 〃 | 医薬品開発のニュース速報サービス、企業発表、特許情報、学会発表など幅広い情報源からニュースを採択。Internet版にてリリース | Windows、Mac | 38万円〜 | − | − |
R&D Backgrounders | 〃 | 〃 | 病気から、関連医薬品、学会情報、関連文献などをレポート。同じ作用機序を持つ医薬品についての開発状況などをレポート。Internet版にてリリース。各レポート毎に契約可能 | 〃 | 詳細問い合わせ | − | − |
Integrity | 〃 | 〃 | 医薬品開発についてのポータルサイト、過去から最新まで16万以上の化合物を収録。化合物を中心に、特許、文献、関連データなどの関連情報を簡単に利用可能。データは毎日更新 | 〃 | 詳細問い合わせ | − | − |
Spartan '02 for Windows (Full Edition) | ウェイブファンクション日本支店 | 米ウェイブファンクション | シンプルな操作画面が特長の分子モデリングパッケージソフトウエア。MM、Ab Initio、Semi-Empirical、DFTなどの各種エンジンによって、構造最適化、配座解析、反応座標解析が可能。B3LYP、LMP2、MP3、MP4やG2、G3、CIS、CIS(D)など導入 | Windows98、NT、Me、2000、XP | 大学19万8,000円、定価50万円。詳細要問い合わせ(授業用価格は応相談) | 2002年1月 | − |
Spartan '02 for Windows (Essential版) | 〃 | 〃 | "Spartan'02 Full Edition"からDFTや励起状態の計算ソルバーを省略した機能限定版。教育システムに最適 | Windows98、Me、2000、NT | 大学12万8,000円、定価25万円。詳細要問い合わせ(授業用価格は応相談) | 2002年1月 | − |
Spartan '02 for Macintosh (Full Edition) | 〃 | 〃 | シンプルな操作画面が特長の分子モデリングパッケージソフトウエア。MM、Ab Initio、Semi-Empirical、DFTなどの各種エンジンによって、構造最適化、配座解析、反応座標解析が可能。B3LYP、LMP2、MP3、MP4やG2、G3、CIS、CIS(D)など導入 | MacOS X 10.2以上 | 大学19万8,000円、定価50万円。詳細要問い合わせ(授業用価格は応相談) | 2003年11月 | − |
Spartan '02 for Windows (Essential版) | 〃 | 〃 | "Spartan'02 Full Edition"からDFTや励起状態の計算ソルバーを省略した機能限定版。教育システムに最適 | MacOS X 10.2以上 | 大学12万8,000円、定価25万円。詳細要問い合わせ(授業用価格は応相談) | 2003年11月 | − |
Spartan '02 for Unix/Linux | 〃 | 〃 | シンプルな操作画面が特長の分子モデリングパッケージソフトウエア。MM、Ab Initio、Semi-Empirical、DFTなどの各種エンジンによって、構造最適化、配座解析、反応座標解析が可能。B3LYP、LMP2、MP3、MP4やG2、G3、CIS、CIS(D)など導入 | SGI IRIX 6.5、Compaq Tru64Unix V5、Red Hat 6.2以上 | Unix大学向け40万円、Linux大学向け28万円。詳細要お問い合わせ | 2002年1月(Unix)、2001年8月(Linux) | − |
XanaGenome | ザナジェン | ザナジェン | 微生物ゲノムの統合データベース。公的なデータベースではアノテーションの基準がそれぞれ異なるが、XanaGenomeでは統一した基準で再アノテーションを実施。使いやすいインタフェースに加え、ゲノム比較、遺伝子翻訳効率予測、自己組織化地図による分類などの独自の機能を備えている。また、プライベートなゲノムデータを追加して閲覧・比較解析を行うことも可能 | インターネット経由でのアクセス、あるいは専用サーバ機との組み合わせ | 年間100万円〜(アカデミックディスカウントあり) | 2002年2月 | 国内外の約20の機関で使用 |
XanaMine | 〃 | 〃 | 非常に強力なデータマイニングアルゴリズムであるSOM(自己組織化地図法)を改良し、ゲノム解析に応用したシステム。ザナジェンで独自に作成した、あるいは解析を受託して作成したデータ(マップ)とそのビューワを合わせて販売。更に解析プログラム自身も単体で販売 | データのビューワはJDK1.1以上のバージョンのJAVA実行環境で動作 | 解析プログラム30万円、ビューワ20万円、マップ30万円〜 | 2002年1月 | 国内数箇所の研究機関にて評価利用中 |
GenomeGambler | 〃 | 海洋科学技術センター、三井情報開発、ザナジェン | 微生物の全ゲノム配列決定プロジェクトを支援するシステム。ベースコール、アセンブル、ORF抽出、ホモロジーサーチ、アノテーション、DDBJ登録といった一連のデータ処理を自動化 | SUN Solaris2.6(UltraSPARCII CPU)以上、あるいはTru64-UNIX 4.0G(Alpha 21264 CPU)以上のワークステーション。PCクラスタによる高速化にも対応 | 150万円 | 1999年12月 | 国内外の約20の機関で使用 |
Phred/Phrap/Consed | 〃 | 米コドンコード | 米国University of Washingtonで開発された、ショットガンシーケンシングに必要なベースコーラ、アセンブラ、コンティグエディタのソフトウェア。世界中の数多くの研究機関で利用されており、非常に高い精度で配列決定を行うことができる | SUN、Compaq、Linuxワークステーション、Windows-PC、Macintosh(詳細はお問合せください) | 112万円(Phred、Cross_match、RepeatMasker、Phrapのサイトライセンスの場合) | − | 全世界で1000サイト以上 |